当前解析结果
SmilChr03G002562| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002562 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002562 |
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 4 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 40820638 - 40821840 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016721 |
|---|---|
| GeneID | 131016721 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016721 |
| 原始查询 | SmilChr03G002562 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | probable membrane-associated kinase regulator 4 |
| 产物 | probable membrane-associated kinase regulator 4 |
| Arabidopsis | AT2G39370 (MAKR4)membrane-associated kinase regulator [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818522] identity=33.2; qcov=1.26; evalue=2.03e-14; confidence=low |
| Rice | Os01g0836900- identity=31.2; qcov=1.51; evalue=1.65e-16; confidence=low |
| GO | GO:0005886 (plasma membrane); GO:0019210 (kinase inhibitor activity) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016721 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801407.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.80000 | XP_057801407.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057801407.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801407.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801407.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:40821087 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 145 | A1,A10,A11,A13,A14,A18,A19,A2,A20,A25,A3,A4,A5,A6,A7,B1,B100,B102,B103,B104,B106,B107,B108,B11,B112,B113,B115,B117,B12,B120,B121,B122,B125,B126,B131,B132,B136,B138,B139,B14,B15,B18,B19,B2,B20,B24,B27,B29,B30,B32,B34,B36,B37,B44,B45,B46,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B58,B59,B61,B62,B63,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B74,B77,B78,B79,B80,B84,B87,B90,B93,B94,B96,B97,B98,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C22,C24,C28,C29,C3,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C4,C42,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C58,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C7,C71,C72,C73,C76,C78,C79,C8,C82,C84,C85,D11,D3,D4,D5,D7,D8 |
Chr3:40821306 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B85,C28,C59 |
Chr3:40821315 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B3 |
Chr3:40821539 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C19 |
Chr3:40821552 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B71,C40 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。