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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002569`

染色体: Chr03 坐标: 40875172-40877988 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002569`
名称	SmilChr03G002569
描述	uncharacterized SmilChr03G002569
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40875172 - 40877988 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018810`
GeneID	`131018810`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018810`
原始查询	`SmilChr03G002569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0202300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0202300` - identity=30.3; qcov=0.421; evalue=2.52e-47; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF17917 (RT_RNaseH); PF17919 (RT_RNaseH_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018810

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803500.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803500.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057803500.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057803500.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803500.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40875183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A20
`Chr3:40875194`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A22,B1,B115,B124,B129,B135,B30,B47,B7,B76,C2,C28,C31,C34,C53,C63,C67
`Chr3:40875201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr3:40875205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B20
`Chr3:40875212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B20,B23
`Chr3:40875243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B46,C37
`Chr3:40875253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B63,C28
`Chr3:40875273`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B52,B77,C62
`Chr3:40875277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C57,C59
`Chr3:40875285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C28
`Chr3:40875303`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B3,B31,C57,C59
`Chr3:40875325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803500.1

902 aa

451

902

RVT_1

RT_RNaseH_2

RT_RNaseH

PF00078 RVT_1 552-711 aa PF17919 RT_RNaseH_2 738-836 aa PF17917 RT_RNaseH 781-865 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803500.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	552	711	2.1e-32	113.4	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057803500.1`	Pfam	`PF17919`	RT_RNaseH_2	Domain	738	836	1.3e-16	61.2	RNase H-like domain found in reverse transcriptase
`XP_057803500.1`	Pfam	`PF17917`	RT_RNaseH	Domain	781	865	4.6e-13	49.9	RNase H-like domain found in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947517.1
ATGACAAGAATAAAGCTAAGAAAGCTGAGGACGCATCAGAAAGAAACAATAGACATCAAGATCGGGCACCTTTCAGAGGGTTGCCCCCCGAGGGTTCCTCCTCCCCAAGCAGAGGTCCCACCTCGCCAACAGCGCACCGTGAATGAGGTCACTCGTTTTGACGAGTACACTCCACTGAACAAACCCCAAGAGGAAATTTTCCATTTAGTAAAAAATCAGCCGTTCTTCAGGGCGCCCGGGAGTTACAGGGACGGGCTGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018810
ATGACAAGAATAAAGCTAAGAAAGCTGAGGACGCATCAGAAAGAAACAATAGACATCAAGATCGGGCACCTTTCAGAGGGTTGCCCCCCGAGGGTTCCTCCTCCCCAAGCAGAGGTCCCACCTCGCCAACAGCGCACCGTGAATGAGGTCACTCGTTTTGACGAGTACACTCCACTGAACAAACCCCAAGAGGAAATTTTCCATTTAGTAAAAAATCAGCCGTTCTTCAGGGCGCCCGGGAGTTACAGGGACGGGCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803500.1
MTRIKLRKLRTHQKETIDIKIGHLSEGCPPRVPPPQAEVPPRQQRTVNEVTRFDEYTPLNKPQEEIFHLVKNQPFFRAPGSYRDGLPQQGPNNKLCEYHNSYGHYTKHCGHLKYQLELLVRQGNLDQFIARGNEGQGERPEHRGERRQDQGNNRDRRREDNRDNRRGAVEDQALPDPPRREVHMILGENGTLTSNRAKKQVLRAVKSGYYLKQVMGITDTIEEPSITFGSEDLRTLMYPHDDALVIKADIASCMVHRVFV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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