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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002575`

染色体: Chr03 坐标: 40971049-40972796 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002575`
名称	SmilChr03G002575
描述	uncharacterized SmilChr03G002575
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	40971049 - 40972796 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018811`
GeneID	`131018811`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018811`
原始查询	`SmilChr03G002575`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00098 (zf-CCHC); PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018811

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803501.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057803501.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803501.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803501.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803501.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:40971054`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	56	A16,A23,A25,A6,B10,B100,B106,B110,B111,B119,B120,B121,B123,B130,B136,B15,B18,B25,B26,B28,B34,B41,B6,B63,B68,B70,B73,B84,B87,B95,C10,C11,C16,C22,C25,C27,C32,C38,C42,C43,C44,C46,C47,C5,C55,C67,C68,C69,C70,C74,C84,C9,D2,D4,D5,D8
`Chr3:40971084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A15,A24,B11,B28,B46,B48,B75,B89,B94,C31,C33,C4,C54,C60,D3
`Chr3:40971111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B75,C33,C4,C54,C60
`Chr3:40971111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B75,C33,C4,C54,C60
`Chr3:40971113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:40971117`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B1,B14,B53,B58,C10,C12,C32
`Chr3:40971123`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B14,B58,C12,C32
`Chr3:40971132`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,C12
`Chr3:40971138`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B58,C12
`Chr3:40971138`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B58,C12
`Chr3:40971198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C8
`Chr3:40971208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803501.1

526 aa

263

526

Retrotran_gag_2

zf-CCHC

PF14223 Retrotran_gag_2 5-109 aa PF00098 zf-CCHC 250-266 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803501.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	5	109	3.1e-09	37.5	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057803501.1`	Pfam	`PF00098`	zf-CCHC	Domain	250	266	0.00037	21.2	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947518.1
ATGAAGCAGAACGAACTGGACAACCTCGCGAAGAACATCATCTCGGGCACCGTTCAAGACAAACACGTGATGAAAATCATAAAGTGCACAACCACCAGAGAAATGTGGAACGCTCTTGAGAGGATGTGTGCTAGATCCGAGGAGATCAAACAAAACAAGTTGTCTATAGCATGTCAAAAGTTTGACAACTTCCAGATGTTGAAGAATGAATTAATTGAAGAAATGGAGTTCAGATTCCACCAAATACTGAATGAAGTCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018811
ATGAAGCAGAACGAACTGGACAACCTCGCGAAGAACATCATCTCGGGCACCGTTCAAGACAAACACGTGATGAAAATCATAAAGTGCACAACCACCAGAGAAATGTGGAACGCTCTTGAGAGGATGTGTGCTAGATCCGAGGAGATCAAACAAAACAAGTTGTCTATAGCATGTCAAAAGTTTGACAACTTCCAGATGTTGAAGAATGAATTAATTGAAGAAATGGAGTTCAGATTCCACCAAATACTGAATGAAGTCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803501.1
MKQNELDNLAKNIISGTVQDKHVMKIIKCTTTREMWNALERMCARSEEIKQNKLSIACQKFDNFQMLKNELIEEMEFRFHQILNEVQAISRNKYTQHEINLKIIRSLTRVDWQMYAIAQQTKPNFNILSTVRLFSDLKANEFDIQRNKDSKKAGTSDDDALLASKGAALKAASRDSKKQSKESTDTKTEDFFSQYALMTEWFNKMESRFRKYKKFHKKNFKGKENEYKPRYSNDKSKEKKSSTPDLKAVECFGCGKEGHY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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