当前解析结果
SmilChr03G002583| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002583 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002583 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002583 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 41092814 - 41094075 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016741 |
|---|---|
| GeneID | 131016741 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016741 |
| 原始查询 | SmilChr03G002583 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | argininosuccinate lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831095]; symbol=AT5G02580; hit=AT5G02580; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | argininosuccinate lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831095]; symbol=AT5G02580; hit=AT5G02580; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT5G02580 (AT5G02580)argininosuccinate lyase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831095] identity=63; qcov=0.893; evalue=5.74e-37; confidence=medium |
| Rice | Os05g0462000- identity=61.5; qcov=0.883; evalue=1.25e-35; confidence=medium |
| GO | GO:0032502 (developmental process) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF09713 (A_thal_3526) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016741 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057801436.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057801436.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057801436.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057801436.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057801436.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057801436.1PF09713
A_thal_3526 14-65 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057801436.1 |
Pfam | PF09713 |
A_thal_3526 | Domain | 14 | 65 | 4.2e-28 | 98.1 | Plant protein 1589 of unknown function (A_thal_3526) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。