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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002600`

染色体: Chr03 坐标: 41297059-41300263 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002600`
名称	SmilChr03G002600
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41297059 - 41300263 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016758`
GeneID	`131016758`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016758`
原始查询	`SmilChr03G002600`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4-like
产物	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4-like
Arabidopsis	`AT5G02850` (AT5G02850) hydroxyproline-rich glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831762] identity=60.6; qcov=1.02; evalue=6.31e-126; confidence=high
Rice	`Os09g0540500` (OsMED4) - identity=50; qcov=0.828; evalue=1.34e-83; confidence=high
GO	GO:0003712 (transcription coregulator activity); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016592 (mediator complex); GO:0070847 (core mediator complex)
KEGG	-
Pfam	PF10018 (Med4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016758

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057801463.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057801463.1`
3	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057801463.1`
4	Spindle pole body	Spindle pole body	0.20000	`XP_057801463.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057801463.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41298832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:41298932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:41298933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B7
`Chr3:41298984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D11
`Chr3:41299017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:41299389`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B117,B20,C1
`Chr3:41299843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B13,B21,B52,C61
`Chr3:41299888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr3:41299945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057801463.1

406 aa

203

406

Med4

PF10018 Med4 127-268 aa

XP_057801464.1

406 aa

203

406

Med4

PF10018 Med4 127-268 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057801463.1`	Pfam	`PF10018`	Med4	Family	127	268	3.9e-10	40.4	Vitamin-D-receptor interacting Mediator subunit 4
`XP_057801464.1`	Pfam	`PF10018`	Med4	Family	127	268	3.9e-10	40.4	Vitamin-D-receptor interacting Mediator subunit 4

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057945481.1
CTGTCAAGAAAAGGTTTCACATACCGTCGGACACGAAGGGAGTAAATCTTACTGTATCTGTATCTTACAAAGTCATAAATATTTCTCTCCGCCGGCCTCACTCTCATTCTCCGCCGGTCTCCCCCGCCCCCGATCGCCCGCCCCGCCCCGCCTCCTCCGCTAGCAGCGCTGCAAGCCGGCAGCATTCCCCCCAGATTCACCGCAGCAGGAGTCCGGCAGACGGCAGTCCTCCTCTACGGCCTCTGCGGCTCCGTCCGGCC...

XM_057945480.1
GAAAAGGTTTCACATACCGTCGGACACGAAGGGAGTAAATCTTACTGTATCTGTATCTTACAAAGTCATAAATATTTCTCTCCGCCGGCCTCACTCTCATTCTCCGCCGGTCTCCCCCGCCCCCGATCGCCCGCCCCGCCCCGCCTCCTCCGCTAGCAGCGCTGCAAGCCGGCAGCATTCCCCCCAGATTCACCGCAGCAGGAGTCCGGCAGACGGCAGTCCTCCTCTACGGCCTCTGCGGCTCCGTCCGGCCTTCACAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131016758
ATGCTGCAAAGCATTCCCCACCAGATTGTGCAATCTCCAGCGAGGTTGGGCCTGCCAAACCCCAACTCGCCATCTCTTCAGAACCCTAACCCACCTAAATTCTCGTCTCAAAACCCACAAACTCAACAGTCCCACCAGCCATTGAATCAGTTAACGACTCCCAGCGTCTCATCAACACTCCTTCCTCTCTTACCACCTCTCCCCAGAGCTCAATCTCTTCTCCTTCAAATGGCATCTCTTGCCTCTAAACTGTTTGAAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057801463.1
MLQSIPHQIVQSPARLGLPNPNSPSLQNPNPPKFSSQNPQTQQSHQPLNQLTTPSVSSTLLPLLPPLPRAQSLLLQMASLASKLFEVSPNRPHWISAFRGSLPSFLSSQSQSPTPAQADSAPSSAKEIIAQFTTLQSQLFEAVAELQEILDLQDAKQKLTRDIRSKDVSLLAFANKLKETEHVLDMLVDDYSDYRRPKRTKSVDDADNSSKTTVETQLKLSDILSYAHKISYTTFAPPEFGAGQAPLRGALPPAPQDEQM...

XP_057801464.1
MLQSIPHQIVQSPARLGLPNPNSPSLQNPNPPKFSSQNPQTQQSHQPLNQLTTPSVSSTLLPLLPPLPRAQSLLLQMASLASKLFEVSPNRPHWISAFRGSLPSFLSSQSQSPTPAQADSAPSSAKEIIAQFTTLQSQLFEAVAELQEILDLQDAKQKLTRDIRSKDVSLLAFANKLKETEHVLDMLVDDYSDYRRPKRTKSVDDADNSSKTTVETQLKLSDILSYAHKISYTTFAPPEFGAGQAPLRGALPPAPQDEQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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