当前解析结果
SmilChr03G002620| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002620 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002620 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002620 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 41596879 - 41597391 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131018818 |
|---|---|
| GeneID | 131018818 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018818 |
| 原始查询 | SmilChr03G002620 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018818 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057803506.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.40000 | XP_057803506.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.20000 | XP_057803506.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803506.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803506.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:41596918 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B74 |
Chr3:41596943 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B125,B29,B81,B91,C73 |
Chr3:41596952 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B20,B93,C19,C78,C83 |
Chr3:41596972 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B4 |
Chr3:41596991 |
A |
AG |
1bp_insertion | frameshift_variant | 4 | A5,B126,B94,C80 |
Chr3:41596991 |
A |
AG |
1bp_insertion | CDS_variant | 4 | A5,B126,B94,C80 |
Chr3:41597093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
Chr3:41597096 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A5,B126,B62,B94,C80 |
Chr3:41597102 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 3 | B140,B63,B83 |
Chr3:41597102 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B63,B83 |
Chr3:41597103 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 33 | A16,A18,A7,A8,B120,B128,B15,B17,B18,B19,B40,B5,B55,B56,B57,B58,B60,B77,B8,B80,B85,B93,B96,C14,C24,C29,C31,C4,C41,C49,C52,C57,C82 |
Chr3:41597275 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 35 | A16,A18,A7,A8,B103,B120,B128,B15,B17,B18,B19,B40,B5,B55,B56,B57,B58,B60,B77,B8,B80,B85,B93,B96,C14,C24,C29,C31,C4,C40,C41,C49,C52,C57,C82 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。