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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002628`

染色体: Chr03 坐标: 41710693-41718773 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002628`
名称	SmilChr03G002628
描述	eukaryotic translation initiation factor 4G-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41710693 - 41718773 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015714`
GeneID	`131015714`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015714`
原始查询	`SmilChr03G002628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	eukaryotic translation initiation factor 4G-like
产物	eukaryotic translation initiation factor 4G-like
Arabidopsis	`AT3G60240` (EIF4G) eukaryotic translation initiation factor 4G [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825194] identity=50.7; qcov=0.637; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0555200` (eIF4Gtsv1) - identity=42.7; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0003743 (translation initiation factor activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0016281 (eukaryotic translation initiation factor 4F complex)
KEGG	-
Pfam	PF02847 (MA3); PF02854 (MIF4G)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015714

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800116.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	1.00000	`XP_057800116.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	1.00000	`XP_057800116.1`
4	P-body	P-body	1.00000	`XP_057800116.1`
5	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057800116.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41711224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B115,B135
`Chr3:41712856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B80
`Chr3:41712928`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:41713184`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr3:41713607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr3:41714246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B22,B48,B64,B94,C24
`Chr3:41714410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr3:41714416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr3:41714673`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B22,B48,B64,C24
`Chr3:41714912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B38,B39,B91,D7
`Chr3:41715012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr3:41715028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800116.1

1740 aa

870

1740

MIF4G

MA3

PF02854 MIF4G 1105-1327 aa PF02847 MA3 1554-1666 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800116.1`	Pfam	`PF02854`	MIF4G	Repeat	1105	1327	7.7e-51	173.4	MIF4G domain
`XP_057800116.1`	Pfam	`PF02847`	MA3	Repeat	1554	1666	1.7e-14	54.4	MA3 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944133.1
ATGCACATATGATATACTGCGTATTGCAGAGTGGTGTCTTCTTCTCTCTCTAGAATTTATCTGCCCACTTCCTTCATCTCTGTTTCCATAAAACACAAAATCACACACTTAATGCACACTACCCTTTTTCTTTTATTTTTTTTCTTCATCTCCTCTTCTTCTTCGTCTTCTCCCGACCCTTTTCATCTTCCCTTAACGGCGTCGTTTGGGCATGGTTCCCGCCATTCCTATCTCCCAGTAGAAACCCTAATTTCTCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015714
ATGTCCCATAATCAATCAAGGGCTGAGAGGAGCGACTCCACGCAGTACAGGAAAACCGGCCGACCCGGTAGCTCCAATCAGCAGCGCCAGTTCCAGGGCAGCGCCTCCAGTAAGGGCGGTGGCGGCGCCCCCTTCAATCCAGCCAGCCGCAGTTTTAATAAGAAGTATAACAGCAATGCCCAAGGTGCTCAGTCGAGGCTAAGAAGTCCGAATGTGGATTCAGATTCTGTGGGACATGCTTTCCAAAATGGTCCTCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800116.1
MSHNQSRAERSDSTQYRKTGRPGSSNQQRQFQGSASSKGGGGAPFNPASRSFNKKYNSNAQGAQSRLRSPNVDSDSVGHAFQNGPQEQQPTQISSTSTNIKLTDAPTQKITQAVPRPPSSDVSTAAPTSNVSAANPESGFPKTPAKGDAAGSFPLQFGSISPGFMNGVQIPARTSSAPPNLDEQKKDQARQNLLRVGPVPIPMPKQPVVKKDAGVPDHTNAREGHPISKSKRDIQISVAPPVTQIQKPAVHSIPGMPMQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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