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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002633`

染色体: Chr03 坐标: 41857372-41861012 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002633`
名称	SmilChr03G002633
描述	uncharacterized SmilChr03G002633
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	41857372 - 41861012 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018820`
GeneID	`131018820`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018820`
原始查询	`SmilChr03G002633`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=23.3; qcov=0.909; evalue=1.36e-36; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=29.1; qcov=0.773; evalue=1.96e-61; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018820

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803509.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803509.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803509.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803509.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:41857385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B17
`Chr3:41857386`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A22,B123,B140,B20,B63,B83,B93,C19,C78,C83
`Chr3:41857401`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,C14,C20
`Chr3:41857427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B38,B39,B91,D7
`Chr3:41857440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr3:41857444`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B3,C77
`Chr3:41857444`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B3,C77
`Chr3:41857460`	`CGA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	82	A14,A16,A5,A6,B102,B103,B111,B120,B124,B125,B126,B128,B129,B137,B138,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B24,B30,B32,B33,B36,B37,B4,B40,B41,B44,B51,B53,B55,B56,B57,B58,B59,B65,B67,B68,B69,B77,B8,B80,B85,B9,B93,B98,B99,C1,C12,C13,C14,C15,C18,C2,C26,C28,C31,C37,C39,C40,C41,C45,C46,C48,C49,C50,C52,C53,C54,C57,C6,C61,C72,C73,C82,C83,D2,D6,D9
`Chr3:41857502`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B57
`Chr3:41857505`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,C34,D10
`Chr3:41857553`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr3:41857604`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B136,B52,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803509.1

662 aa

331

662

DBD_Tnp_Mut

SWIM

PF03108 DBD_Tnp_Mut 117-181 aa PF04434 SWIM 509-538 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803509.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	117	181	4.4e-07	30.2	MuDR family transposase
`XP_057803509.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	509	538	2.8e-07	30.6	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947526.1
ATGGAAGGGGCTAATGATGGTGGTGCTGTGGATAATGAGGCAGGGGCTAATGAGGCAGGGGCAGGGGCAAAGGCAGGGGCTGTGGATAATGAGGAGGGGGCAGAGGGTAATGAGGAGGAGGATAGTGATGATACTGAGTGGATTGAAGAAGCTGAGGATTTAGGGAACTTGTTTGATTTTGCTGATACTGCAGAGGCTATAGAGGACTTTGACACTGGTGTAGAGAAGGTTTCTGAATATGAGGGCAGTGAGGATGATGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018820
ATGGAAGGGGCTAATGATGGTGGTGCTGTGGATAATGAGGCAGGGGCTAATGAGGCAGGGGCAGGGGCAAAGGCAGGGGCTGTGGATAATGAGGAGGGGGCAGAGGGTAATGAGGAGGAGGATAGTGATGATACTGAGTGGATTGAAGAAGCTGAGGATTTAGGGAACTTGTTTGATTTTGCTGATACTGCAGAGGCTATAGAGGACTTTGACACTGGTGTAGAGAAGGTTTCTGAATATGAGGGCAGTGAGGATGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803509.1
MEGANDGGAVDNEAGANEAGAGAKAGAVDNEEGAEGNEEEDSDDTEWIEEAEDLGNLFDFADTAEAIEDFDTGVEKVSEYEGSEDDVQSSETDEELEGERHRKKRVIYDPKCCHADLQIVLGMQFEDGIQCRSALTNVAIETGRFIHFRNVSKKCCLAKCTLPCPWRVLGSLQRKEGIFKIKQYAGDHTCIRQTRNKMVSSTWIAARYLNVFRVKYDMSIKELRDDILVRFKTDVYRDRLYKAKKKAQEIVKGFIEVHYG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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