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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002641`

染色体: Chr03 坐标: 42016540-42016929 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002641`
名称	SmilChr03G002641
描述	adenylate isopentenyltransferase 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42016540 - 42016929 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018821`
GeneID	`131018821`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018821`
原始查询	`SmilChr03G002641`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	adenylate isopentenyltransferase 1, chloroplastic-like
产物	adenylate isopentenyltransferase 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT1G68460` (IPT1) isopentenyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843175] identity=51.3; qcov=0.922; evalue=2.33e-34; confidence=medium
Rice	`Os01g0688300` (OsIPT8) - identity=46.7; qcov=0.946; evalue=4.35e-27; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006400 (tRNA modification); GO:0009691 (cytokinin biosynthetic process); GO:0009824 (AMP dimethylallyltransferase activity); GO:0052381 (tRNA dimethylallyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01715 (IPPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018821

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057803510.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057803510.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057803510.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803510.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42016550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B101,B28,B46,D3
`Chr3:42016568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,B74
`Chr3:42016569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B74
`Chr3:42016595`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B127,B128,B17
`Chr3:42016595`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B127,B128,B17
`Chr3:42016662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B22
`Chr3:42016663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,C24
`Chr3:42016737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C73
`Chr3:42016751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C54
`Chr3:42016759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C73
`Chr3:42016764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:42016778`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C5,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803510.1

129 aa

129

IPPT

PF01715 IPPT 50-124 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803510.1`	Pfam	`PF01715`	IPPT	Domain	50	124	9.7e-15	55.6	IPP transferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947527.1
ATGGCCTCCGCCGCCGCCGTCTCCTCCCGCCGCCACAAGAAGATCGTGGTGGTGATGGGCCCCACGGGCTGCGACAAGACCAAACTCTCCATCGACCTGGTGTCGAGATTCTTCCGATCGTCGGAGATCGTCAACTCCGACAAAATCCAAATCCACCGCGGCCTCGACATCACCACCAACAAAATCCATCCCCGCGACCGGGAGAACGTCCCCCACCACCTCCTGGGCGAGTTCGACTCGTTCGAGTCGCACCCCAAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018821
ATGGCCTCCGCCGCCGCCGTCTCCTCCCGCCGCCACAAGAAGATCGTGGTGGTGATGGGCCCCACGGGCTGCGACAAGACCAAACTCTCCATCGACCTGGTGTCGAGATTCTTCCGATCGTCGGAGATCGTCAACTCCGACAAAATCCAAATCCACCGCGGCCTCGACATCACCACCAACAAAATCCATCCCCGCGACCGGGAGAACGTCCCCCACCACCTCCTGGGCGAGTTCGACTCGTTCGAGTCGCACCCCAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803510.1
MASAAAVSSRRHKKIVVVMGPTGCDKTKLSIDLVSRFFRSSEIVNSDKIQIHRGLDITTNKIHPRDRENVPHHLLGEFDSFESHPKFTPSDFRLAASLLISRIHSRHNTPFVVGGSNSFIYALLASGTR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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