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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002662`

染色体: Chr03 坐标: 42280749-42283805 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002662`
名称	SmilChr03G002662
描述	transcription termination factor MTERF4, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42280749 - 42283805 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015847`
GeneID	`131015847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015847`
原始查询	`SmilChr03G002662`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription termination factor MTERF4, chloroplastic
产物	transcription termination factor MTERF4%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G44020` (AT2G44020) Mitochondrial transcription termination factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819007] identity=75.5; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0783100` - identity=65.3; qcov=0.898; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003690 (double-stranded DNA binding); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02536 (mTERF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057800272.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057800272.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800272.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800272.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800272.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42281086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B132,B8
`Chr3:42281095`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A15,A2,A8,B1,B10,B12,B123,B23,B24,B3,B4,B68,B86,C10,C18,C40,C63,C75
`Chr3:42281216`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,D7
`Chr3:42281971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr3:42282091`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr3:42282195`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,B66
`Chr3:42282423`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B62,C80
`Chr3:42282442`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B81,B91,C16,C39
`Chr3:42282480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,A8,B101,B29,B57
`Chr3:42282546`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,B99,C26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800272.1

501 aa

250

501

mTERF

PF02536 mTERF 142-450 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800272.1`	Pfam	`PF02536`	mTERF	Family	142	450	6.7e-115	384.0	mTERF

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944289.1
TAATTCTTCAAAAATATATCCTGAAATTCTACAAAGTGTAATTATATTATATTATATTTATATAAAAAAACCCAGAAATCCTAGAACAACTAGGCGCCGCTCTCACATTTCGTCTCCTCTACAGCACGACACAAGGTAAGGTTGATTGGTATATGAATGATGATGGAGATTAGCTAAAATAATTTGCATATTTCTAATCGATCTTAATTTAACTTTCAGCCGATAATTTTGATTGTTATTAAACCAGCCTTCTTTCAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015847
ATGGCTGCGATTTTGAGAAAAACCAGTCAAATAAATTCCATATTCTGCAAAACTCCCAAAAATCCATTTTTTGCGCTACCTCTTAAACCCTTGCAAAACCCCAACTCCCAATTTTGTCATGAGCTGCTTCGAGGAGCCTTTTCGACGAAGTCGTCGAATTTCCCCGAATACGAGATGCCAACTGTGACTTGGGGTGTGATTCAAGGCCGAAAGGAGAAATTGGTGTCTAGGGTCATAATTTGTGATTACATGAAATCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800272.1
MAAILRKTSQINSIFCKTPKNPFFALPLKPLQNPNSQFCHELLRGAFSTKSSNFPEYEMPTVTWGVIQGRKEKLVSRVIICDYMKSLGIVPDELEELELPSTVEVMRERIEFLQKIGLTIDDINEYPLMLGCSVRKNMVPVLGYLEKIGIPRARMGEFVKNYPQCLHASVVVELAPVIKFLRGLDVEKQDMGYVLMKYPELLGFKLEGTMSTSVAYLVSIGVNPRDIGPMVTQYPYILGMRVGTMIKPLVDYLVSLGLPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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