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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002664`

染色体: Chr03 坐标: 42300221-42301075 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002664`
名称	SmilChr03G002664
描述	uncharacterized mitochondrial protein AtMg00810-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42300221 - 42301075 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018829`
GeneID	`131018829`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018829`
原始查询	`SmilChr03G002664`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=high
产物	orf490; symbol=orf490; hit=gene-orf490; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`ATMG00810` - identity=45.6; qcov=0.81; evalue=5.29e-63; confidence=high
Rice	`gene-orf490` (orf490) - identity=46.9; qcov=0.961; evalue=2.57e-76; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07727 (RVT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018829

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803516.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803516.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803516.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803516.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803516.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42300245`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B103,B125,B41,B74,B97,C10,C12,C39,C47,C73,C74
`Chr3:42300266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A22
`Chr3:42300407`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B120,B56,B58,B96,B98,C57
`Chr3:42300475`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B40,B44,B76,C2
`Chr3:42300484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B53,B66,B8
`Chr3:42300519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B53,B66,B94,C83
`Chr3:42300586`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	64	A10,A14,A19,A23,A25,A5,A7,B10,B108,B112,B121,B124,B125,B126,B129,B130,B131,B134,B137,B138,B139,B140,B15,B16,B17,B2,B26,B30,B32,B33,B4,B41,B48,B51,B59,B63,B64,B70,B72,B73,B81,B84,B94,C11,C15,C18,C2,C22,C23,C39,C45,C48,C50,C52,C54,C55,C56,C6,C69,C72,C73,C84,D2,D9
`Chr3:42300759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B53,B66,B8
`Chr3:42300778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B56,B82,C65
`Chr3:42300787`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B53,B66,B8
`Chr3:42300802`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr3:42300838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B111,B120,B126,B135,B28,B36,B48,B56,B58,B96,B98,C32,C38,C57,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803516.1

284 aa

142

284

RVT_2

PF07727 RVT_2 5-88 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803516.1`	Pfam	`PF07727`	RVT_2	Domain	5	88	2.4e-15	57.6	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947533.1
ATGCGCAAGAATGGAAGATTATTACTTGTTCTTGTTTATGTGGATGATATATTAATTACAGGAGAAGATTCATCTACTATTGCAGCTCTTATCAGCTCTCTTTCTACAACATTTGCTCTGAATTCATTAGGCACGGTCAACTATTTCCTTGGTATTCAAGTGATTAAGACTGAGAGTAACTCCTATCAGTTGAATCAGTCCAAGTATATCCAGGACTTGCTCACTAAAACAAATCTTGTAAACAACAAACCGCAGCCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018829
ATGCGCAAGAATGGAAGATTATTACTTGTTCTTGTTTATGTGGATGATATATTAATTACAGGAGAAGATTCATCTACTATTGCAGCTCTTATCAGCTCTCTTTCTACAACATTTGCTCTGAATTCATTAGGCACGGTCAACTATTTCCTTGGTATTCAAGTGATTAAGACTGAGAGTAACTCCTATCAGTTGAATCAGTCCAAGTATATCCAGGACTTGCTCACTAAAACAAATCTTGTAAACAACAAACCGCAGCCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803516.1
MRKNGRLLLVLVYVDDILITGEDSSTIAALISSLSTTFALNSLGTVNYFLGIQVIKTESNSYQLNQSKYIQDLLTKTNLVNNKPQPSPYDLGTKLHAADSPMFSDPTLFRSTVGALQYLTLSRPDISFSVNKLSQFLHQPTELHWKACKRLLRYLKEAMDYSLIFPSSSQFLHLTVFSDADWADLLDDHKSTGGYCVFLSSNLLSWSSKKQNVVSRSSTESEYRALADSSVEVIWITSLLSEFGITLPQKPILWCDNKSV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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