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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002677`

染色体: Chr03 坐标: 42487483-42488733 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002677`
名称	SmilChr03G002677
描述	late embryogenesis abundant protein 6-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42487483 - 42488733 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015865`
GeneID	`131015865`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015865`
原始查询	`SmilChr03G002677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	late embryogenesis abundant protein 6-like
产物	late embryogenesis abundant protein 6-like
Arabidopsis	`AT1G32560` (AtLEA4-1) Late embryosis abundant protein, group 1 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840150] identity=48.5; qcov=0.475; evalue=2.43e-08; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0009793 (embryo development ending in seed dormancy)
KEGG	-
Pfam	PF03760 (LEA_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015865

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800291.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057800291.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057800291.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800291.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800291.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42487574`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C10
`Chr3:42487574`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C10
`Chr3:42487577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800291.1

139 aa

139

LEA_1

PF03760 LEA_1 1-69 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800291.1`	Pfam	`PF03760`	LEA_1	Domain	1	69	2.6e-12	47.8	Late embryogenesis abundant (LEA) group 1

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944308.1
TATAAAGTTTCTTCTCATCATTTACATGCATTTGCTCCAAATTCAGAAAATACAACGGTGAAAGTAAAAGTTTAGCGAAGATGCAGGCCATCAAGGAGAAGATAAATGACTTGAAGGAAATCCGAAAAGCCAAGGCTGAAGCAAAAGAGGGGGAAAAAGCAGAGAGAGAGCTAGCAAGAGCTCGACTGGAGGTGGCTCATGAGGTGAGGATGGCGAGGGAGGCTGAGGCGGCGATGGATTATCACGTCCAGAAAGCGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015865
ATGCAGGCCATCAAGGAGAAGATAAATGACTTGAAGGAAATCCGAAAAGCCAAGGCTGAAGCAAAAGAGGGGGAAAAAGCAGAGAGAGAGCTAGCAAGAGCTCGACTGGAGGTGGCTCATGAGGTGAGGATGGCGAGGGAGGCTGAGGCGGCGATGGATTATCACGTCCAGAAAGCGGCGGAGAAGGCGGCGGAGCACGAGAAGAAGTTCCCTCAGGATGGGTTAAGGGCCGAGGATGGCGGCGATGAATCTCATGGCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800291.1
MQAIKEKINDLKEIRKAKAEAKEGEKAERELARARLEVAHEVRMAREAEAAMDYHVQKAAEKAAEHEKKFPQDGLRAEDGGDESHGRAMANSSEPPAPYSSDLYSGGAAPDSGHNKANFIDAASSPSEAAAPPSQNNFL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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