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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002683`

染色体: Chr03 坐标: 42604463-42611829 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002683`
名称	SmilChr03G002683
描述	uncharacterized SmilChr03G002683
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42604463 - 42611829 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018832`
GeneID	`131018832`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018832`
原始查询	`SmilChr03G002683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0656500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0656500` - identity=27.4; qcov=0.143; evalue=1.38e-07; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding)
KEGG	-
Pfam	PF13976 (gag_pre-integrs); PF14223 (Retrotran_gag_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018832

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057803517.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803517.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803517.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803517.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803517.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42604571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C40
`Chr3:42604610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr3:42604629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C3,C5,C87
`Chr3:42604665`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr3:42604667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B35,B46
`Chr3:42604690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B82,C82
`Chr3:42604696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:42604705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:42604745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B20,C54,D3
`Chr3:42604780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	13	A23,A7,B101,B132,B133,B47,B53,B58,B66,B70,C19,C34,C76
`Chr3:42604821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C21,C63
`Chr3:42604835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	78	A10,A18,A23,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B101,B108,B118,B122,B124,B125,B127,B131,B132,B137,B14,B15,B19,B2,B20,B21,B23,B24,B26,B30,B36,B4,B42,B47,B5,B50,B53,B57,B58,B59,B66,B70,B74,B78,B80,B89,B92,B98,B99,C12,C14,C19,C2,C20,C21,C23,C25,C26,C31,C32,C34,C36,C4,C41,C43,C44,C49,C55,C61,C68,C74,C76,C79,C82,C83,D11,D4,D6,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803517.1

947 aa

474

947

Retrotran_gag_2

gag_pre-integrs

PF14223 Retrotran_gag_2 61-212 aa PF13976 gag_pre-integrs 689-732 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803517.1`	Pfam	`PF14223`	Retrotran_gag_2	Domain	61	212	3e-21	76.6	gag-polypeptide of LTR copia-type
`XP_057803517.1`	Pfam	`PF13976`	gag_pre-integrs	Domain	689	732	6.8e-08	32.9	GAG-pre-integrase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947534.1
ATGGATGTGGTTATTGCTTCGGTTCGTCCTCCTGCCTTGGATAGTAGTGGGAAGAACTATTCCTTGTGGAAAACTAGGATGAAGATGTACATAAAATCCATTGATGAACGTGCCTGGGCTGTTGTGTTGGATGGATGGACTCCACCGCGTGTTACTGATGATGTTGGCAACATTACTCCTAAACCAGAAAGTCAATGGAGTGCAGATGAACGACTTATTTCTAGTCACAACTCCAGAGCTTTGAAGGCTATTTTTATCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018832
ATGGATGTGGTTATTGCTTCGGTTCGTCCTCCTGCCTTGGATAGTAGTGGGAAGAACTATTCCTTGTGGAAAACTAGGATGAAGATGTACATAAAATCCATTGATGAACGTGCCTGGGCTGTTGTGTTGGATGGATGGACTCCACCGCGTGTTACTGATGATGTTGGCAACATTACTCCTAAACCAGAAAGTCAATGGAGTGCAGATGAACGACTTATTTCTAGTCACAACTCCAGAGCTTTGAAGGCTATTTTTATCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803517.1
MDVVIASVRPPALDSSGKNYSLWKTRMKMYIKSIDERAWAVVLDGWTPPRVTDDVGNITPKPESQWSADERLISSHNSRALKAIFISVDVPCFRLISNCVEARDAWFILQEQCEGSASVRATKLRMLTTKFEILRMHEDETIPAYYEKLCEISNETLGLGKPISNERLVSKMLRSLPERYNMKISSIEATADVTSIRIGDLVRKLVTFETNLEQQKPGYYLKNVAFHVDKSASAIDVTDNVESADVDLEDDDDVNLVMLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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