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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002693`

染色体: Chr03 坐标: 42898191-42899268 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002693`
名称	SmilChr03G002693
描述	uncharacterized SmilChr03G002693
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42898191 - 42899268 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018833`
GeneID	`131018833`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018833`
原始查询	`SmilChr03G002693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=27.3; qcov=0.876; evalue=4.43e-12; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=26.5; qcov=0.801; evalue=8.24e-10; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018833

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057803519.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803519.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803519.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803519.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42898200`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A10,B131,B46,B82,C32,C68,C73,D1
`Chr3:42898643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B110,C29
`Chr3:42898679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C84
`Chr3:42898692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B126,C19,C20
`Chr3:42898697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr3:42898735`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B46,C32,D7
`Chr3:42898748`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C84
`Chr3:42898770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr3:42898775`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A9,B22,B37,B42,B65,C45,C67
`Chr3:42898789`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,C8
`Chr3:42898821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B66,B73,B85,C65,C79
`Chr3:42898886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803519.1

226 aa

113

226

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 43-120 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803519.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	43	120	2.3e-14	54.5	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947536.1
ATGGTTGTGGAAACTGTTTTCAGGTTGGAGTTCGATCACAATCGACCAGATTCTCGAATTTGGGTGACTTCAAAAGATGGAATGTTTCATCCAAGGGACCTGTACTTCGCCATTGCAAATGCATCAACAAGTGAGGAACAAGCTACAGATCATTGGCCAAGTTTGTGGTGGAAAGCCATTCCGTTGAAGGTTTCGGCTTTTGTTTGGAAAGCATTGCTTGATAGATTGCCAACGAAGGATAATTTGATTAAAAGAGGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018833
ATGGTTGTGGAAACTGTTTTCAGGTTGGAGTTCGATCACAATCGACCAGATTCTCGAATTTGGGTGACTTCAAAAGATGGAATGTTTCATCCAAGGGACCTGTACTTCGCCATTGCAAATGCATCAACAAGTGAGGAACAAGCTACAGATCATTGGCCAAGTTTGTGGTGGAAAGCCATTCCGTTGAAGGTTTCGGCTTTTGTTTGGAAAGCATTGCTTGATAGATTGCCAACGAAGGATAATTTGATTAAAAGAGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803519.1
MVVETVFRLEFDHNRPDSRIWVTSKDGMFHPRDLYFAIANASTSEEQATDHWPSLWWKAIPLKVSAFVWKALLDRLPTKDNLIKRGILHSQEDGVCSLCWVQDESSCHVLLICYEALLVWSKVCGWIDCSLLYAATLKEHFEEFVSFGVGKVKKKILGLIWQCVVWRIWKARNEKIFKNSIPIAENIVESIKFCSWKWLKAHYPSSFYASLHEWSSHPILCMPTNL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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