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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002695`

染色体: Chr03 坐标: 42936360-42938244 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002695`
名称	SmilChr03G002695
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 15
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42936360 - 42938244 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018834`
GeneID	`131018834`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018834`
原始查询	`SmilChr03G002695`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 15
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 15
Arabidopsis	`AT3G52370` (FLA15) FASCICLIN-like arabinogalactan protein 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824402] identity=88.4; qcov=0.456; evalue=2.11e-98; confidence=medium
Rice	`Os03g0788600` (OsFLA24) - identity=85.5; qcov=0.509; evalue=2.94e-105; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018834

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057803520.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057803520.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057803520.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803520.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803520.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42936402`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A10,A7,A8,B120,B133,B25,B29,B36,B40,B41,B42,B43,B56,B58,B81,B88,B90,B92,B96,B97,B98,C10,C16,C29,C57,C58,C74,C85,D10,D11,D3,D5
`Chr3:42936442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:42936476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B102,B126,B57,B65,B9,C33,C61,D1
`Chr3:42936510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C19
`Chr3:42936511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B111
`Chr3:42936514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B94,B99,C26
`Chr3:42936524`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C34,C58
`Chr3:42936591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:42936628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B6,C34,C58
`Chr3:42936715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr3:42937516`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B112,B114,B16,B19,B53,C6,C62
`Chr3:42937524`	`T`	`TTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	20	A10,A11,A13,B109,B110,B124,B126,B29,B40,B46,B49,B63,B67,B79,C36,C49,C52,C64,C66,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803520.1

340 aa

170

340

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 60-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803520.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	60	173	7.3e-08	33.4	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947537.1
CGGTTGCTGATTCCGAAATCAGTCTAGCAGGACTTCAACGCGCGGCGGAGTCTCCGCGCCACTTCCGCCGTTCTGCCGGAGGTCAACCCGAGAACGCACCGCCTGAAGAAGGCCACGCCGCCACAGCCTGCCGGCGCGGCACCAGTTTTCCCAATCTTCGATGCCATGGCTCCCAGCCCCTCCCTGGCTCCGGCACCCGCCCCCGGCCCCGACGGACCCCACCACCACTTCAACGGGGAGAGCCAGGTCAAGGATTTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018834
ATGGCTCCCAGCCCCTCCCTGGCTCCGGCACCCGCCCCCGGCCCCGACGGACCCCACCACCACTTCAACGGGGAGAGCCAGGTCAAGGATTTCATCCAGACCCTCCTGCATTACGGTGATTACAACGAATTGGCCGATATCCTGGTGAATCTGACCTCACTGGCCACTGAGACGGGGAGGCTGGTTTCCGAGGGCTATGTGTTGACGGTTTTGGCGCCGAACGACGAGGCGATGGCGAAGCTGACTACGGACCAGCTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803520.1
MAPSPSLAPAPAPGPDGPHHHFNGESQVKDFIQTLLHYGDYNELADILVNLTSLATETGRLVSEGYVLTVLAPNDEAMAKLTTDQLSEPGAPEQIMYYHLIPEYQTEESMYNSVRRFGKVNYDTLKLPHKVVAEEADGSVKFGQGEGFAYLFDPDIYTDGRISVQGVDGVLFPDGGNHRSAQIKKNKNKTDDLYQLTTCLEVERRLVELRQTQEEVTPSDVDRIFREVVTPNPWGRIMGLGMMMSKAITESGESSSTHST...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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