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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002701`

染色体: Chr03 坐标: 42973220-42973996 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002701`
名称	SmilChr03G002701
描述	uncharacterized SmilChr03G002701
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	42973220 - 42973996 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018836`
GeneID	`131018836`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018836`
原始查询	`SmilChr03G002701`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0545250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G24255` (AT3G24255) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822013] identity=31; qcov=0.826; evalue=3.13e-22; confidence=low
Rice	`Os09g0545250` - identity=37.8; qcov=0.554; evalue=2.1e-29; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018836

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803522.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803522.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057803522.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803522.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803522.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:42973237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B13,B8,D11
`Chr3:42973259`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B13,B8,D11
`Chr3:42973296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B38,B39,B91,D7
`Chr3:42973307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B28,B46,D3
`Chr3:42973338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr3:42973339`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B108,B114,B19,B3,B47,B53,B74,C41,C76
`Chr3:42973352`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	61	A16,A23,A25,B100,B112,B119,B121,B124,B125,B129,B130,B131,B136,B15,B17,B18,B25,B26,B27,B30,B4,B48,B51,B59,B6,B60,B63,B70,B71,B72,B73,B84,B95,C10,C15,C18,C22,C23,C24,C25,C27,C29,C39,C40,C43,C45,C47,C52,C54,C56,C64,C66,C67,C70,C72,C81,C84,D11,D2,D4,D8
`Chr3:42973358`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B94,B99,C26
`Chr3:42973424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:42973426`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B137,C19
`Chr3:42973430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B13,B8
`Chr3:42973498`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B118,B13,B8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947539.1
ATGAATATTCGTAGGAGGATGTTTACTGGAGTGCGTGTGGCTAAGCATAGTCCGATGGTGTCTCACCTATTCTTTGCGGATGATAGCCTCCTGTTTTTCAATGCCAAGGCCATTGGAGCTCAAGCTATCCGTCAAGCTCTGGACCTCTATTCTGCCGCATTTGGTCAACTTGTGAACTTTGAGAAATCTGCGGTCTCCTTTAGCCCGTGTGTGTCTCGGCAGGATATGGATAAAGTGGTTTCTATTTTGGGTGTTAAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018836
ATGAATATTCGTAGGAGGATGTTTACTGGAGTGCGTGTGGCTAAGCATAGTCCGATGGTGTCTCACCTATTCTTTGCGGATGATAGCCTCCTGTTTTTCAATGCCAAGGCCATTGGAGCTCAAGCTATCCGTCAAGCTCTGGACCTCTATTCTGCCGCATTTGGTCAACTTGTGAACTTTGAGAAATCTGCGGTCTCCTTTAGCCCGTGTGTGTCTCGGCAGGATATGGATAAAGTGGTTTCTATTTTGGGTGTTAAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803522.1
MNIRRRMFTGVRVAKHSPMVSHLFFADDSLLFFNAKAIGAQAIRQALDLYSAAFGQLVNFEKSAVSFSPCVSRQDMDKVVSILGVKETNGQAVYLGLPTFVVRHKMIQFDYLRERVYKKLNSWKNRYFSVEGKEVLIKSIIQATPTCTMSYFKIPSAVCHDIEMACANFWRGESDIGKCLYWVSWKALCEQKSKGGMGFRRMEAFNRALLAKQVWRLVKFPSSLVARVLKGSTTKMMIFSLLESSLMPPISGPRSVGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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