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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002708`

染色体: Chr03 坐标: 43042579-43045722 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002708`
名称	SmilChr03G002708
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 30
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43042579 - 43045722 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015893`
GeneID	`131015893`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015893`
原始查询	`SmilChr03G002708`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 30
产物	probable xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase protein 30
Arabidopsis	`AT1G32170` (XTH30) xyloglucan endotransglucosylase/hydrolase 30 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840109] identity=63.2; qcov=0.922; evalue=7.03e-145; confidence=high
Rice	`Os02g0127800` (OsXTH26) - identity=58; qcov=0.859; evalue=2.37e-121; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005618 (cell wall); GO:0010411 (xyloglucan metabolic process); GO:0016762 (xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity); GO:0042546 (cell wall biogenesis); GO:0048046 (apoplast)
KEGG	-
Pfam	PF00722 (Glyco_hydro_16); PF06955 (XET_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015893

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057800366.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057800366.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800366.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800366.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800366.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43042654`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A7,B80,C42
`Chr3:43042654`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A7,B80,C42
`Chr3:43042656`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	3	A7,B80,C42
`Chr3:43042656`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A7,B80,C42
`Chr3:43043083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr3:43043124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C62,C64
`Chr3:43043127`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C62,C64
`Chr3:43043256`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B128,B40,B42
`Chr3:43045139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B24,B41,B93,C17
`Chr3:43045320`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C26
`Chr3:43045325`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B19,B69
`Chr3:43045328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800366.1

333 aa

166

333

Glyco_hydro_16

XET_C

PF00722 Glyco_hydro_16 43-222 aa PF06955 XET_C 263-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800366.1`	Pfam	`PF00722`	Glyco_hydro_16	Domain	43	222	7.7e-56	189.0	Glycosyl hydrolases family 16
`XP_057800366.1`	Pfam	`PF06955`	XET_C	Family	263	298	2.1e-15	57.0	Xyloglucan endo-transglycosylase (XET) C-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944383.1
ATGAATCATGATTTGATAGCAGCAATGAAGAAGCTCATCCAATATTCTCTCTCATCAATCTATCTTCTTCTTCTTCTCGTGGACGTAGGTTGTGCGTTGAACACAACCCCCTTCTCCAAAGGCTTCACCCCTCTTTTTGGTCATCCAAATATCATCCCTTCTCTCGACGATCGATCCCTTCAACTTCATCTCAATCAATACACAGGGTCGGGATTCAAATCCGCAGAGGTGTACAAGTACGGGTTGTTCAGCGCCAAAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015893
ATGAATCATGATTTGATAGCAGCAATGAAGAAGCTCATCCAATATTCTCTCTCATCAATCTATCTTCTTCTTCTTCTCGTGGACGTAGGTTGTGCGTTGAACACAACCCCCTTCTCCAAAGGCTTCACCCCTCTTTTTGGTCATCCAAATATCATCCCTTCTCTCGACGATCGATCCCTTCAACTTCATCTCAATCAATACACAGGGTCGGGATTCAAATCCGCAGAGGTGTACAAGTACGGGTTGTTCAGCGCCAAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800366.1
MNHDLIAAMKKLIQYSLSSIYLLLLLVDVGCALNTTPFSKGFTPLFGHPNIIPSLDDRSLQLHLNQYTGSGFKSAEVYKYGLFSAKIKLPSDYAAGVVVAFYTTNGDMFGKTHDELDFEFLGNIRGKAWRFQTNMYGNGSTNRGREERYYLWFHPSKHFHRYTIFWTTTNIIFYIDDVPIREIVRNDAMGADFPSKPMALYATIWDASDWATSGGKYKANYKYAPFVAEFSDLVLNGCAAYPVEEVVATGCDEINDQLAI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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