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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002710`

染色体: Chr03 坐标: 43057702-43058997 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002710`
名称	SmilChr03G002710
描述	uncharacterized SmilChr03G002710
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43057702 - 43058997 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018837`
GeneID	`131018837`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018837`
原始查询	`SmilChr03G002710`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0650800; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0650800; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os01g0650800` - identity=46; qcov=0.777; evalue=8.95e-97; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018837

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803523.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803523.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803523.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803523.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057803523.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43057710`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A14,B50,B69
`Chr3:43057710`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A14,B50,B69
`Chr3:43057808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,B69
`Chr3:43057811`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,B103,B2,B83,B94,B98,C12,C40,C59
`Chr3:43057841`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B76,C2
`Chr3:43057851`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:43057915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B38,B39,B91,D7
`Chr3:43057916`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B118,B13,B28,D3
`Chr3:43057917`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B121,B135,C26
`Chr3:43057935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	A20,B20,B37,B38,B39,B53,B66,B80,B91,B93,C19,C60,C78,C83,D7
`Chr3:43057950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B80,C8
`Chr3:43057957`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803523.1

431 aa

216

431

Transposase_21

PF02992 Transposase_21 172-382 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803523.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	172	382	5e-91	304.4	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947540.1
ATGATTCACGATGCGTATGATGTATATGAAAATAACCCAACCCATTTTCAGACGTTGCTTGAAGACGCTGAAAAACCTTTATATCCCGGTTGTAGTAAATTTACTAAGCTATCTGCCACCATTAAATTGTACAATTTGAAGGCGAAACATGGTTGGAGTGATACTAGTTTCAATGATCTATTGAAATTGATAAGAGAAATGCTCACTGAAACCAATTCCATGCCTTTTTCTTTGTACGATGCAAAGAAAACCTTAAGCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018837
ATGATTCACGATGCGTATGATGTATATGAAAATAACCCAACCCATTTTCAGACGTTGCTTGAAGACGCTGAAAAACCTTTATATCCCGGTTGTAGTAAATTTACTAAGCTATCTGCCACCATTAAATTGTACAATTTGAAGGCGAAACATGGTTGGAGTGATACTAGTTTCAATGATCTATTGAAATTGATAAGAGAAATGCTCACTGAAACCAATTCCATGCCTTTTTCTTTGTACGATGCAAAGAAAACCTTAAGCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803523.1
MIHDAYDVYENNPTHFQTLLEDAEKPLYPGCSKFTKLSATIKLYNLKAKHGWSDTSFNDLLKLIREMLTETNSMPFSLYDAKKTLSTLGLDYEKIHACPNDCILYRKEYLDSSDCPTCGMSRWKVNKKGKVMSEVPSKVLWYFPPIPRFRRMFRTREIAKELVWHADERKHDGKLRHPANAPAWRLVDNKWPDFGNEPRNLRLALAADGMNPHNMMSSNYSCWPVVLVTYNLPPWLCIKRRFMMLSLLIFGPKQPGNDID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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