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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002713`

染色体: Chr03 坐标: 43087794-43095524 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002713`
名称	SmilChr03G002713
描述	actin-binding protein wsp1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43087794 - 43095524 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018839`
GeneID	`131018839`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018839`
原始查询	`SmilChr03G002713`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-binding protein wsp1-like
产物	actin-binding protein wsp1-like
Arabidopsis	`AT2G32840` (AT2G32840) proline-rich family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817845] identity=42.4; qcov=0.757; evalue=3.93e-52; confidence=medium
Rice	`Os03g0234600` - identity=41; qcov=0.305; evalue=3.61e-17; confidence=low
GO	GO:0017053 (transcription repressor complex)
KEGG	-
Pfam	PF15306 (LIN37)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018839

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057803524.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.80000	`XP_057803524.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803524.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803524.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057803524.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43087822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C21,C31
`Chr3:43087824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B58,C21,C31
`Chr3:43087828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:43087845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B76,C2
`Chr3:43087845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C2
`Chr3:43087848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B78
`Chr3:43087855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B128,B48,C14,C3
`Chr3:43087870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C38
`Chr3:43087873`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:43087876`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B127,B128,B48,C14,C3
`Chr3:43087876`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B127,B128,B48,C14,C3
`Chr3:43087879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803524.1

383 aa

192

383

LIN37

PF15306 LIN37 245-366 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803524.1`	Pfam	`PF15306`	LIN37	Family	245	366	1.8e-10	41.9	LIN37

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947541.1
ATGGATGTGCGGGGAGCATGCGAATCTCCCGCTCGACATGTCGATGTGGCACGAGTGCCACCTGACAACCACACAGCGACGCATGCAAAAGAGGCATGCGACTGTCTTGAGTCCCGAGCTGTTGTGCATGTTGCTTGTGGGTTGCTAACGATAAGTGTTCAAATCAAGGTAGCTAACCTCTTTCAAAAACAAAAACCGCGCCACCCCCACCGATGGCCCCCTCCACCCCTCCTCCGCCACCGGACGCTTCAAACGCCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018839
ATGGATGTGCGGGGAGCATGCGAATCTCCCGCTCGACATGTCGATGTGGCACGAGTGCCACCTGACAACCACACAGCGACGCATGCAAAAGAGGCATGCGACTGTCTTGAGTCCCGAGCTGTTGTGCATGTTGCTTGTGGGTTGCTAACGATAAGTGTTCAAATCAAGGTAGCTAACCTCTTTCAAAAACAAAAACCGCGCCACCCCCACCGATGGCCCCCTCCACCCCTCCTCCGCCACCGGACGCTTCAAACGCCGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803524.1
MDVRGACESPARHVDVARVPPDNHTATHAKEACDCLESRAVVHVACGLLTISVQIKVANLFQKQKPRHPHRWPPPPLLRHRTLQTPPPPPPQQQQDLYFFSPKLIKPYTRLVSLPIPTLITLNWPPVPPHPHPHPQDPSQLLYPLASSGRGFLRPVALPASRPAQRPPFMFPYLDQGQGNPVFVRPNHLPHVLIGSAPGTSGNAAATGAMPAVVKGIPVPSSHQPKVGLPSASISDNNGHKDSRDRTKDDAFVIIRDRKV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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