当前解析结果
SmilChr03G002715| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002715 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002715 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002715 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 43110914 - 43112917 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015899 |
|---|---|
| GeneID | 131015899 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015899 |
| 原始查询 | SmilChr03G002715 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ecotropic viral integration site protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819043]; symbol=AT2G44360; hit=AT2G44360; species=arabidopsis; confidence=high |
| 产物 | ecotropic viral integration site protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819043]; symbol=AT2G44360; hit=AT2G44360; species=arabidopsis; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G44360 (AT2G44360)ecotropic viral integration site protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819043] identity=75.2; qcov=0.813; evalue=3.98e-54; confidence=high |
| Rice | Os09g0553800- identity=67.7; qcov=0.446; evalue=1.14e-26; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015899 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057800378.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057800378.1 |
| 3 | Cytoskeleton | 细胞骨架 | 0.40000 | XP_057800378.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057800378.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800378.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:43112644 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B127,B128,B48,C3 |
Chr3:43112739 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 21 | B10,B101,B115,B134,B38,B39,B47,B50,B60,B71,B75,B78,B8,C11,C21,C35,C45,C59,C63,C69,C86 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。