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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002719`

染色体: Chr03 坐标: 43214346-43215872 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002719`
名称	SmilChr03G002719
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43214346 - 43215872 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015901`
GeneID	`131015901`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015901`
原始查询	`SmilChr03G002719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit B-3-like
Arabidopsis	`AT4G14540` (NF-YB3) nuclear factor Y, subunit B3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827101] identity=81.3; qcov=0.695; evalue=1.46e-52; confidence=high
Rice	`Os03g0413000` (NFYB8) - identity=81.3; qcov=0.695; evalue=1.5e-52; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016602 (CCAAT-binding factor complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015901

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800380.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057800380.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800380.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800380.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800380.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43215322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B63
`Chr3:43215334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B9
`Chr3:43215335`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B29,C20
`Chr3:43215336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B39,B91
`Chr3:43215364`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C40
`Chr3:43215393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B55,B83
`Chr3:43215398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B12,B140,B55,B63,C48
`Chr3:43215398`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B12,B140,B55,B63,C48
`Chr3:43215407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,B31
`Chr3:43215432`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B26,B96,C45
`Chr3:43215432`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B26,B96,C45
`Chr3:43215455`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B3,C42,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800380.1

131 aa

131

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 8-71 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800380.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	8	71	1.3e-25	90.1	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944397.1
AAAAAAAGGGAATTTAAGAAACTTTACATCTTTTTTAATTACTTTAATTTTTAGTTCAAATTTTACGATGAGCCATTAATATGTACGTACAATGTCAATTATAATGAATATGTATCAACCATTTTTTAAAATAAAATTTTATATATAAAAAAAAAAGAAAAATAAAAAAATTTAACAACCCTTTAAAATGTAGAACTCAAACAAAGAGTCGAGCCTCATCAAAACTTCATCTGGGAAAACTGTACGATGAATAGATCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015901
ATGAAAGATCAAGAAAGGGTGGTACCGATCGCGAACGTGAGCCGGATCATGAAGAAATCCCTCCCTCCTAACGCCAAGATCTCAAAGGAAGCGAAAGAAACAGTGCAGGAATGCGTGTCGGAGTTCATAAGCTTCGTGACGGGGGAGGCCTCTGATAAATGCCAGAGGGAGAAGAGGAAGACCACCAATGGCGATGATCTGCTGTGGGCCATGACAACTCTTGGATTCCAGAACTATGTTGACCCCCTTAAGGATTATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800380.1
MKDQERVVPIANVSRIMKKSLPPNAKISKEAKETVQECVSEFISFVTGEASDKCQREKRKTTNGDDLLWAMTTLGFQNYVDPLKDYLTTYRDTSSPIHDKTKIANANPSFLQGFTSDAGGVVIEFATSSWC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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