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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002746`

染色体: Chr03 坐标: 43643536-43646067 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002746`
名称	SmilChr03G002746
描述	uncharacterized SmilChr03G002746
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43643536 - 43646067 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018847`
GeneID	`131018847`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018847`
原始查询	`SmilChr03G002746`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0142900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0142900` - identity=33.3; qcov=0.37; evalue=3.5e-38; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1); PF13456 (RVT_3); PF17921 (Integrase_H2C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018847

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803529.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057803529.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803529.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803529.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057803529.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43643548`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	167	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A7,A9,B10,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B109,B115,B117,B118,B119,B12,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B130,B131,B132,B134,B136,B137,B138,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B25,B26,B27,B29,B30,B35,B36,B40,B47,B49,B5,B50,B52,B54,B55,B56,B59,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B80,B82,B83,B84,B85,B87,B88,B90,B92,B93,B94,B95,B99,C1,C11,C13,C14,C18,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C33,C36,C37,C40,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C5,C51,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C60,C61,C62,C65,C66,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D9
`Chr3:43643563`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C39
`Chr3:43643631`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr3:43643651`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	32	A6,B101,B114,B120,B126,B135,B139,B27,B28,B3,B33,B45,B56,B57,B58,B65,B67,B69,B75,B8,B80,B83,B89,B96,C10,C14,C39,C41,C49,C52,C55,C59
`Chr3:43643689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,D11
`Chr3:43643704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A24,B21,B40,C53,C59,C74,D3
`Chr3:43643712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr3:43643730`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B12,B137,B55,C2,C38
`Chr3:43643730`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B12,B137,B55,C2,C38
`Chr3:43643740`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A15,A16,A21,A22,A5,B110,B23,B28,B4,B50,B60,B68,B86,C12,C63,C64,C87,D3,D5
`Chr3:43643762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:43643776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B51,B64,C42,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803529.1

625 aa

312

625

RVT_1

RVT_3

Integrase_H2C2

PF00078 RVT_1 111-270 aa PF13456 RVT_3 287-396 aa PF17921 Integrase_H2C2 485-536 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803529.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	111	270	5.4e-31	108.8	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)
`XP_057803529.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	287	396	9.7e-15	55.3	Reverse transcriptase-like
`XP_057803529.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	485	536	3.4e-12	47.0	Integrase zinc binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947546.1
ATGGTTATTGAGCTTTTCACGGATAAGGAGGGATTCACTACCAAAATCGGGGCACACATGGAACCAGAGCTGCAAAGAAAGGTAATAGCTTGCCTGCGCAGAAACGCTGATGTATTTGCGTTCAAAACGGCGGACCTAAAGGGAATTGACAGAGAGCTAGCCGAGCATCGATTGAACGTAGACCCCACAATTAAGCCAGTGAAACAAAAGACGAGGCACTTCGGTGCTGAAAAGGACGCCGCTATTCGGGAGCAGGTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018847
ATGGTTATTGAGCTTTTCACGGATAAGGAGGGATTCACTACCAAAATCGGGGCACACATGGAACCAGAGCTGCAAAGAAAGGTAATAGCTTGCCTGCGCAGAAACGCTGATGTATTTGCGTTCAAAACGGCGGACCTAAAGGGAATTGACAGAGAGCTAGCCGAGCATCGATTGAACGTAGACCCCACAATTAAGCCAGTGAAACAAAAGACGAGGCACTTCGGTGCTGAAAAGGACGCCGCTATTCGGGAGCAGGTACA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803529.1
MVIELFTDKEGFTTKIGAHMEPELQRKVIACLRRNADVFAFKTADLKGIDRELAEHRLNVDPTIKPVKQKTRHFGAEKDAAIREQVQALLEAGHIVEVQYPEWVSNAVMVEKNAKTWRMCVDYRDLNAACPKDCYPLPRIDQLVDATSGCELLSMMDAYQGYHQVKTYRNDVVKTAFAVCAGIFAYVSMSFGLKNAGATYQRMMDRIFKDQLKENVSVYVDDMLVRSAEARTHADDLEEIFSVVRRHKLMLNPAKCTFGV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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