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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002760`

染色体: Chr03 坐标: 43880518-43882441 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002760`
名称	SmilChr03G002760
描述	B3 domain-containing protein Os04g0386900-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43880518 - 43882441 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015935`
GeneID	`131015935`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015935`
原始查询	`SmilChr03G002760`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 domain-containing protein Os04g0386900-like
产物	B3 domain-containing protein Os04g0386900-like
Arabidopsis	`AT3G06160` (AT3G06160) AP2/B3-like transcriptional factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819790] identity=33.8; qcov=0.458; evalue=1.49e-07; confidence=low
Rice	`Os04g0386900` - identity=34.1; qcov=0.821; evalue=2.77e-16; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015935

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800440.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800440.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800440.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800440.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800440.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43880808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B77,C48
`Chr3:43880815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B77,C48
`Chr3:43880856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,C60,C87
`Chr3:43880903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B102
`Chr3:43881004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,A21,B132,B57
`Chr3:43881011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B4,B52,C41
`Chr3:43881038`	`GCT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	71	A16,A18,A2,A21,A22,A6,A9,B100,B106,B11,B114,B12,B125,B127,B132,B136,B15,B16,B17,B21,B25,B26,B29,B35,B37,B51,B52,B54,B55,B63,B64,B68,B69,B70,B72,B74,B82,B86,B93,B94,B95,B97,B99,C10,C15,C18,C20,C21,C24,C29,C30,C36,C39,C4,C41,C42,C43,C47,C48,C51,C59,C62,C65,C74,C78,C8,C81,C85,C87,D1,D9
`Chr3:43881041`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	68	A16,A18,A2,A21,A22,A6,A9,B100,B106,B11,B114,B12,B125,B127,B132,B136,B15,B16,B17,B21,B25,B26,B29,B35,B37,B52,B54,B55,B63,B64,B68,B69,B70,B72,B74,B82,B86,B94,B95,B97,B99,C10,C15,C18,C20,C21,C24,C29,C30,C36,C39,C4,C41,C42,C43,C47,C48,C59,C62,C65,C74,C78,C8,C81,C85,C87,D1,D9
`Chr3:43881559`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:43881594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr3:43881597`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A19,B140,B4,C64,C66
`Chr3:43881597`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A19,B140,B4,C64,C66

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800440.1

168 aa

168

PF02362 B3 53-136 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800440.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	53	136	4.8e-13	49.6	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944457.1
ATTCCATCGAAGGCTGAGGGAGTTGTATCGACAAGCAGGTGTGCAGTTGAGCAAGGTAGAAGGAGAGCAGCTTCATTTACTTGGTTTCTACTTTCTAGTGAGAGAATATCAACAGAAGATGTGGAATCCTTCCAAACAAGACGCTCGCTCCATTCCTGAGAAGAAGGGGGTTCTCAAAGCGAATGAAGAAAATCCTGCTGCAGCTCAAGTAGAAGTGGATGATGGACTCCCCTGTCTCTCTGGGGACAAACCATTTTTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015935
ATGTGGAATCCTTCCAAACAAGACGCTCGCTCCATTCCTGAGAAGAAGGGGGTTCTCAAAGCGAATGAAGAAAATCCTGCTGCAGCTCAAGTAGAAGTGGATGATGGACTCCCCTGTCTCTCTGGGGACAAACCATTTTTTGATGTTATCCTCAAAGAATTAGATATCTGCAATCTGATTGTGCCAAAGCATATGTTTCGCAAGCTTCCTCGTGATGTTGTGCCTATGGTTCTCACACACGGTGGCAAGAAGTGGAACAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800440.1
MWNPSKQDARSIPEKKGVLKANEENPAAAQVEVDDGLPCLSGDKPFFDVILKELDICNLIVPKHMFRKLPRDVVPMVLTHGGKKWNMSYNGKVKQHKFESTGWRNFVADNNLECGDACIFELMESGPKGVRLRVVILRNTYYLPPQLQAKIPDGEANGMTPETAIEID

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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