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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002763`

染色体: Chr03 坐标: 43938625-43942850 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002763`
名称	SmilChr03G002763
描述	AUGMIN subunit 7
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43938625 - 43942850 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015938`
GeneID	`131015938`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015938`
原始查询	`SmilChr03G002763`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AUGMIN subunit 7
产物	AUGMIN subunit 7
Arabidopsis	`AT5G17620` (AUG7) nuclear matrix protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831628] identity=83.5; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0869500` - identity=74.9; qcov=0.988; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0007098 (centrosome cycle); GO:0051011 (microtubule minus-end binding); GO:0051225 (spindle assembly); GO:0070652 (HAUS complex)
KEGG	-
Pfam	PF06694 (Plant_NMP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015938

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Centrosome	中心体	1.00000	`XP_057800443.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057800443.1`
3	Spindle	Spindle	1.00000	`XP_057800443.1`
4	Spindle pole	Spindle pole	1.00000	`XP_057800443.1`
5	Midbody	Midbody	1.00000	`XP_057800443.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43940884`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B115,B81,C31,C52,C80
`Chr3:43940884`	`C`	`CA`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B115,B81,C31,C52,C80
`Chr3:43940934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B78,B8
`Chr3:43941086`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:43941175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr3:43942610`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B77,C48
`Chr3:43942619`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,B37,B77,C48

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800443.1

331 aa

166

331

Plant_NMP1

PF06694 Plant_NMP1 6-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800443.1`	Pfam	`PF06694`	Plant_NMP1	Family	6	324	1.7e-198	659.0	Plant nuclear matrix protein 1 (NMP1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944460.1
AGAAAAGAGCATACGAAAGTAGCAATATTACACGATTCTCCTTCAATATAACAACTTCGATTTGAAAATAACGAAATTCAACTACAACAGAAAAACAAAAGAAACTTCAAATCATCTGCTAACCCCTTTCACTTCCTACAAATTTCCCCAAATCCTACCCAATCTCCGCGGTTTGATTTGGGTTCACGTTGGAATCGGGCCACACAGCATGGCGGCGAAGCAAATGGAAGAAGTGCAGAAGAAATTGGCGATGTTGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015938
ATGGCGGCGAAGCAAATGGAAGAAGTGCAGAAGAAATTGGCGATGTTGAATTACCCCAGAGCCAATGCGCCGGCACAGTCGCTCCTCTTTGCCGGCATGGAACGCTACGCCCTTCTTGAATGGCTCTTCTTCAAATTATTGGGCGATAAATCTCCCTTTTCGCAGCAGAATCTACAGGGAGATGCTGTAGATCGAGATGAAGAGACCTCCAGGATACAATATTTGGCAGAGATTGCAAAATTTTTGGGTATTACCACTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800443.1
MAAKQMEEVQKKLAMLNYPRANAPAQSLLFAGMERYALLEWLFFKLLGDKSPFSQQNLQGDAVDRDEETSRIQYLAEIAKFLGITTTIDTEAIQGRGSYEDRTEMLRLIVDLVEASIYADNPEWSVDEQVAKDIQLIDAIAEKQAQIFSEECKLFPADVQIQSIYPLPEISDLEKQLSDQSNRLLNLQEMVDDLASKHPYNPDEDYMDVEAKLRAHLESFLETARSFNTIYTKEIRPWTHMMEVPQLHGFGPAANRLLEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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