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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002764`

染色体: Chr03 坐标: 43942996-43944440 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002764`
名称	SmilChr03G002764
描述	aspartic proteinase CDR1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43942996 - 43944440 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015937`
GeneID	`131015937`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015937`
原始查询	`SmilChr03G002764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase CDR1-like
产物	aspartic proteinase CDR1-like
Arabidopsis	`AT1G64830` (AT1G64830) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842791] identity=40.4; qcov=0.954; evalue=1.56e-98; confidence=medium
Rice	`Os07g0533600` (OJ1131_E05.101) - identity=33.4; qcov=0.836; evalue=9.03e-50; confidence=low
GO	GO:0005576 (extracellular region)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015937

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057800442.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800442.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800442.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800442.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43942994`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A1,B104,B108,B110,B114,B118,B120,B122,B19,B22,B23,B24,B3,B36,B42,B43,B45,B47,B56,B58,B65,B77,B87,B9,B96,B98,C13,C23,C26,C34,C38,C50,C55,C56,C57,C58,C7,C71,C76,C82,C85,D6
`Chr3:43943001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:43943010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:43943120`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A13,A15,B88,C2,C62,C64,C66,C81,C86,D4
`Chr3:43943235`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr3:43943431`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C85
`Chr3:43943439`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr3:43943568`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:43943658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:43943667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B91,C16
`Chr3:43943673`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B107,B69,C1,C4,D10
`Chr3:43943673`	`C`	`CCT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B107,B69,C1,C4,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800442.1

433 aa

216

433

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 87-257 aa PF00026 Asp 87-425 aa PF14541 TAXi_C 278-426 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800442.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	87	257	5.4e-46	157.7	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057800442.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	87	425	1.4e-13	51.7	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057800442.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	278	426	1.9e-20	74.0	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944459.1
ATGGCGATTTTCATGTCATTTCGTAGAGTTCTTTCCTTGTTCCTTTTAGCATTATTCTCCACATTTTCTGCATCAGAACCAAACTATGATGGCTTTAGCATTGATTTTATTCACAGGGACTCCTTAATCTCTTCTCTGCAAAACTCAACAGCAAGTTACAGCAGCCTCATAAATAGAGCCTTACAGCGCTCCAAGAGGCGTGCTGATTATTTGGCATCGGGTACTCCCACTGCCGACCTGATAGCTTCCAGTGGAGAGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015937
ATGGCGATTTTCATGTCATTTCGTAGAGTTCTTTCCTTGTTCCTTTTAGCATTATTCTCCACATTTTCTGCATCAGAACCAAACTATGATGGCTTTAGCATTGATTTTATTCACAGGGACTCCTTAATCTCTTCTCTGCAAAACTCAACAGCAAGTTACAGCAGCCTCATAAATAGAGCCTTACAGCGCTCCAAGAGGCGTGCTGATTATTTGGCATCGGGTACTCCCACTGCCGACCTGATAGCTTCCAGTGGAGAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800442.1
MAIFMSFRRVLSLFLLALFSTFSASEPNYDGFSIDFIHRDSLISSLQNSTASYSSLINRALQRSKRRADYLASGTPTADLIASSGEFLVKLSVGTPPVEVSVLLDTTSVLSWTQCAPCDHCFPQKQPLFTTKKSSTYKVVAGNSKPCKLLGGTPSTSGDNSCRYSLFYPQRYHSRGVISSDTFTMKTTSGMPMSLPNMVFGCGHDNYAEFKGDTSGVVGLGVGPSSLVTQMNSVIGGKFSYCLVPSNAKPSKMHFGSRAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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