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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002765`

染色体: Chr03 坐标: 43948284-43949415 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002765`
名称	SmilChr03G002765
描述	aspartic proteinase CDR1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	43948284 - 43949415 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015939`
GeneID	`131015939`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015939`
原始查询	`SmilChr03G002765`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartic proteinase CDR1-like
产物	aspartic proteinase CDR1-like
Arabidopsis	`AT1G64830` (AT1G64830) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842791] identity=50.3; qcov=1; evalue=2.26e-115; confidence=high
Rice	`Os04g0448300` - identity=36.9; qcov=1.02; evalue=2.24e-70; confidence=medium
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0005576 (extracellular region); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015939

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057800444.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057800444.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800444.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800444.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800444.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:43948331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B29,B54,B86,C20,C46
`Chr3:43948333`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B69,C1,C4,D10
`Chr3:43948336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:43948351`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:43948351`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:43948396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:43948411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:43948424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B66
`Chr3:43948595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr3:43948614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11
`Chr3:43948648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr3:43948671`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800444.1

362 aa

181

362

Asp

TAXi_N

TAXi_C

PF00026 Asp 12-355 aa PF14543 TAXi_N 13-182 aa PF14541 TAXi_C 205-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800444.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	12	355	4.7e-29	102.5	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057800444.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	13	182	2.6e-51	175.0	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057800444.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	205	355	7.4e-28	98.1	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944461.1
TCTAAATCGCGTCAACTCTCCGACACAACACCGTTCTCCACAAATGGCGCCAGTTGATATTCTTTCTGAAAAAGGAGAATACCTAATGAAAATCTCCATTGGTACGCCGCCGGTCGAAACTCTAGTCGTTGCTGACACCGGCAGCGACCTCACTTGGATTCAATGCAAGCCTTGTACACATTGCTTTCGTCAGAATGCGCCACTTTTTCAACCTAAGCTTTCTTCAACGTACAAACCAATAGGTTGTACTTCTAGTCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015939
ATGGCGCCAGTTGATATTCTTTCTGAAAAAGGAGAATACCTAATGAAAATCTCCATTGGTACGCCGCCGGTCGAAACTCTAGTCGTTGCTGACACCGGCAGCGACCTCACTTGGATTCAATGCAAGCCTTGTACACATTGCTTTCGTCAGAATGCGCCACTTTTTCAACCTAAGCTTTCTTCAACGTACAAACCAATAGGTTGTACTTCTAGTCCGTGCAACGCTCTTCGTGGGAGGACTTCTTGCGACAGTTTTGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800444.1
MAPVDILSEKGEYLMKISIGTPPVETLVVADTGSDLTWIQCKPCTHCFRQNAPLFQPKLSSTYKPIGCTSSPCNALRGRTSCDSFEGTCRYTIGYGDTSFSNGYLATETIRLGSVAIPNVVIGCGHYNRGTFDAHVAGIIGLGGGELSLITQMRSLTLGKFSYCLGSYIGGTSYSSKMSFGDDVGVVGDDVATTPLVAKSPKTFYFLTLEGISVGSERIDFDSPSTSSSSNGSKGIEEGNIIIDSGTTLTFLPKELYNQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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