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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002770`

染色体: Chr03 坐标: 44067501-44069366 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002770`
名称	SmilChr03G002770
描述	transcription factor bHLH91-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44067501 - 44069366 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015943`
GeneID	`131015943`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015943`
原始查询	`SmilChr03G002770`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH91-like
产物	transcription factor bHLH91-like
Arabidopsis	`AT2G31210` (AT2G31210) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817677] identity=35.7; qcov=1.03; evalue=1.24e-59; confidence=medium
Rice	`Os04g0599300` (EAT1) - identity=36.7; qcov=0.744; evalue=7.12e-43; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0048658 (anther wall tapetum development)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015943

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800447.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800447.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800447.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800447.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800447.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44067846`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B115,B78,B8
`Chr3:44067999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B5,B57
`Chr3:44068141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B68
`Chr3:44068148`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	A23,B68,B75
`Chr3:44068148`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	3	A23,B68,B75
`Chr3:44068158`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B28,B68,B75,C15
`Chr3:44068161`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B28,B68,B75,C15
`Chr3:44068185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,B68
`Chr3:44068186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	A23,B68,B75,C15
`Chr3:44068186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B68,B75,C15
`Chr3:44068193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B77,C48
`Chr3:44068195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B68,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800447.1

416 aa

208

416

HLH

PF00010 HLH 224-271 aa

XP_057800448.1

403 aa

202

403

HLH

PF00010 HLH 224-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800447.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	224	271	6.7e-08	32.9	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057800448.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	224	271	6.4e-08	33.0	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944464.1
TGGAGTGGTAGTGCCCTCCTAACCCATACCATACTCAACCAACCCACAAAATTTTCATCTCCCATCTCTCTCACTCTCTTTTCTCCTTTTCACAGAGAAGTTTTGATTTTCAGTTATCAATCGTGTTTTTTAGGTACACTGACAGAATCAGAGAAATCAACAGCTTTGATTTGAATAGAAAAGATGTATCAAGAAAATGGTGGGTTCGATGAAAGCGGCATTACGCATCAAGCCGAGGACGCTTTCTCCCAAACCCAGTT...

XM_057944465.1
TGGAGTGGTAGTGCCCTCCTAACCCATACCATACTCAACCAACCCACAAAATTTTCATCTCCCATCTCTCTCACTCTCTTTTCTCCTTTTCACAGAGAAGTTTTGATTTTCAGTTATCAATCGTGTTTTTTAGGTACACTGACAGAATCAGAGAAATCAACAGCTTTGATTTGAATAGAAAAGATGTATCAAGAAAATGGTGGGTTCGATGAAAGCGGCATTACGCATCAAGCCGAGGACGCTTTCTCCCAAACCCAGTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015943
ATGTATCAAGAAAATGGTGGGTTCGATGAAAGCGGCATTACGCATCAAGCCGAGGACGCTTTCTCCCAAACCCAGTTACCAAACTGCAACACCTTCTCAATGGAGGAGCAGTCGTACCCCCAAAACGACGTGGCCGCCGCCGTCGCCGCCGCCTCGGCGCTGGAGATGGAGCTGCAGCACCAGCTAGAGATGGAGCAGTGCTACACCAACAAAAGCGCCGCCGAAATGGGCAACGAATCCTCAAACTGGCAAGAGATGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800447.1
MYQENGGFDESGITHQAEDAFSQTQLPNCNTFSMEEQSYPQNDVAAAVAAASALEMELQHQLEMEQCYTNKSAAEMGNESSNWQEMAGSFNHQNPAADFNQFYGATASMGEAPDLLNIFPLPRCSPSSLLPNFSQKSPAFLASLGLLGDVNDGVVYDPLLPLNLPPQPPLLRELFHSLPHGHGYSGLFTDERDANGGLYQNGDRLYEFNAAEMGAKNRDGIKDAKHFATEKHRRVLLNDKYQALRALVATPTKNDRASIV...

XP_057800448.1
MYQENGGFDESGITHQAEDAFSQTQLPNCNTFSMEEQSYPQNDVAAAVAAASALEMELQHQLEMEQCYTNKSAAEMGNESSNWQEMAGSFNHQNPAADFNQFYGATASMGEAPDLLNIFPLPRCSPSSLLPNFSQKSPAFLASLGLLGDVNDGVVYDPLLPLNLPPQPPLLRELFHSLPHGHGYSGLFTDERDANGGLYQNGDRLYEFNAAEMGAKNRDGIKDAKHFATEKHRRVLLNDKYQALRALVATPTKNDRASIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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