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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002772`

染色体: Chr03 坐标: 44118631-44121461 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002772`
名称	SmilChr03G002772
描述	transcription factor bHLH91-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44118631 - 44121461 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015945`
GeneID	`131015945`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015945`
原始查询	`SmilChr03G002772`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor bHLH91-like
产物	transcription factor bHLH91-like
Arabidopsis	`AT2G31210` (AT2G31210) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817677] identity=39.4; qcov=1.16; evalue=1.79e-80; confidence=medium
Rice	`Os04g0599300` (EAT1) - identity=47.7; qcov=0.512; evalue=7.67e-54; confidence=medium
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0048658 (anther wall tapetum development)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015945

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800450.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800450.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800450.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800450.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800450.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44118794`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B80,C8
`Chr3:44118794`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B80,C8
`Chr3:44118850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr3:44118976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B126,B35,B64,C24
`Chr3:44119039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:44119042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B133
`Chr3:44119062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:44119079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:44119142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr3:44119145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:44119156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr3:44119315`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,B122,B19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800450.1

377 aa

188

377

HLH

PF00010 HLH 194-237 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800450.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	194	237	1.9e-09	37.9	Helix-loop-helix DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944467.1
TATATCAACCCACACCATATCCAACTTCAACAGATTTTTCAAATATCTCTCCCTCTTTTACAACTTAATCTAGGTACACTAACACAAATATAAATTACACAGGCACAGAAATCAAAGGTTTGAATTTAAGAAGAAGAAAAAAAGATGTATGAAGAAAACAGTGGTTTGGATGAAAGCAGCAGTATGCATGTAGATAGAGGTGGATTGAGTCAAGGTGAGGATGCTTTCTCCCAAACCCACTGCAACAACTTCATCACGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015945
ATGTATGAAGAAAACAGTGGTTTGGATGAAAGCAGCAGTATGCATGTAGATAGAGGTGGATTGAGTCAAGGTGAGGATGCTTTCTCCCAAACCCACTGCAACAACTTCATCACGGAGGAGCAATCCTACCCTCAAAACGACGTCGCCGCCCTAGAGATGGAGCTGCAGATCGAGCAGTGCTTCACCAACAACAACAAAATTCATGATATGGCGCACCACGCCTCTAATTGGCAAGACATCACCACTGGCCATTACCAAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800450.1
MYEENSGLDESSSMHVDRGGLSQGEDAFSQTHCNNFITEEQSYPQNDVAALEMELQIEQCFTNNNKIHDMAHHASNWQDITTGHYQIFAAQASFTDAPDLPAIFPPPSSLLPNFPQKTPAFSASSSSVVYDPLLALNKPPSFRDLFYGGGVYTLGVDEREANVGFYENGDGVFEFTAAEMGENGDAIKDTKQHSSEKRRRVELKGKYESLRLLIPSPSKNDKASVLADAIRYIKELKRTVTELKDLVERKRFARERLKRP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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