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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002773`

染色体: Chr03 坐标: 44130448-44136336 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002773`
名称	SmilChr03G002773
描述	protein EMSY-LIKE 3
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44130448 - 44136336 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015946`
GeneID	`131015946`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015946`
原始查询	`SmilChr03G002773`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein EMSY-LIKE 3
产物	protein EMSY-LIKE 3
Arabidopsis	`AT5G13020` (EML3) Emsy N Terminus (ENT)/ plant Tudor-like domains-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831142] identity=55; qcov=1.02; evalue=1.23e-139; confidence=high
Rice	`Os08g0328300` - identity=54.2; qcov=1.05; evalue=2.07e-138; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0050832 (defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF03735 (ENT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015946

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800451.1`
2	Nuclear speckle	核斑点	0.20000	`XP_057800451.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800451.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800451.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44131776`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B124,B125,B14,C72
`Chr3:44131793`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr3:44131969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,B32
`Chr3:44132085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B27,B57,C48,C77
`Chr3:44132121`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr3:44132124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B37,C5,C80
`Chr3:44132142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	42	A11,A14,A23,A24,A9,B102,B105,B117,B128,B140,B20,B25,B26,B27,B29,B30,B35,B45,B46,B53,B64,B66,B84,B94,C19,C27,C31,C33,C36,C39,C45,C46,C48,C51,C53,C56,C6,C70,C72,C74,C77,C82
`Chr3:44132159`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A13,A16,B112,B131,B31,C17,C21,C49,C73,C79
`Chr3:44132162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38
`Chr3:44132203`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A13,A22,B132,B67,B97,C11,C67,C81
`Chr3:44132208`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	A13,B67,C11,C67
`Chr3:44132226`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800451.1

431 aa

216

431

ENT

PF03735 ENT 51-130 aa

XP_057800452.1

408 aa

204

408

ENT

PF03735 ENT 51-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800451.1`	Pfam	`PF03735`	ENT	Domain	51	130	1.6e-31	108.8	ENT domain
`XP_057800452.1`	Pfam	`PF03735`	ENT	Domain	51	130	1.5e-31	109.0	ENT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944468.1
TACCAAAATCACACGTGTGGAAATTCTGTCTGAAGCGAGGCAAAAACACTTTGGAACATGGACACAACAAAATCAAAAGAGGCGGAATTCAAACCTTTCATTCCTAAGCCAATTTAATAAACACATTTCACGTCCGCGTAACCCAAAACACCCACAGCGCGCATACGCAGACGCGCGGACGCTGGCAGAAATCAACAAAATTGAATCCCAGCTTGCAATTTCAGTTCCAAAAAGTTGAAAATTTCAAGTTTTCCTGACGC...

XM_057944469.1
GGAACATGGACACAACAAAATCAAAAGAGGCGGAATTCAAACCTTTCATTCCTAAGCCAATTTAATAAACACATTTCACGTCCGCGTAACCCAAAACACCCACAGCGCGCATACGCAGACGCGCGGACGCTGGCAGAAATCAACAAAATTGAATCCCAGCTTGCAATTTCAGTTCCAAAAAGTTGAAAATTTCAAGTTTTCCTGACGCCGTGGAATTGGTTTTAGGGTTTCCTTGTTTTGGGCTGCGAGAAATTGTGAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015946
ATGGACTACGAGCCGTACGACAGTAGTGGAACTGACGATGATTTTCCTCCACCACATCAAAATAGAATGTCAAGAGGGGGCCACATTTCTGGTAATGGAAGGCCTGCCGCTTTGAATTCTCACCCATTTCCCCGGATTTATGAGGAGACTGACATGGAAGCTAAAATTCACCAGCTTGAGCAAGAAGCATACAGTTCAGTTCTAAGAGCTTTTAAAGCTCAAGATGATGCCATTACTTGGGAGAAGGAAAGTGTAATTAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800451.1
MDYEPYDSSGTDDDFPPPHQNRMSRGGHISGNGRPAALNSHPFPRIYEETDMEAKIHQLEQEAYSSVLRAFKAQDDAITWEKESVITELRKELRLSNEEHRDLLSRVNADETIRRIREWRQSGGLQQSIHGANQPVHDAVLSPSISASRKKQKIAPQLPSVSFGGPSPSFHPQAIATTNQPSSSAVKRGPMSGTKGKKHKSIPPGSSTKMRHPSGPAGRGQFSSRIGALPNERPQGSFDPLIGRKVRTRWPDDNNFYEAV...

XP_057800452.1
MDYEPYDSSGTDDDFPPPHQNRMSRGGHISGNGRPAALNSHPFPRIYEETDMEAKIHQLEQEAYSSVLRAFKAQDDAITWEKESVITELRKELRLSNEEHRDLLSRVNADETIRRIREWRQSGGLQQSIHGANQPVHDAVLSPSISASRKKQKIAPQLPSVSFGGPSPSFHPQAIATTNQPSSSAVKRGPMSGTKGKKHKSIPPGSSTKMRHPSGPAGRGQFSSRIGALPNERPQGSFDPLIGRKVRTRWPDDNNFYEAV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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