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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002779`

染色体: Chr03 坐标: 44226147-44229024 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002779`
名称	SmilChr03G002779
描述	O-fucosyltransferase 20-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44226147 - 44229024 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015950`
GeneID	`131015950`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015950`
原始查询	`SmilChr03G002779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	O-fucosyltransferase 20-like
产物	O-fucosyltransferase 20-like
Arabidopsis	`AT2G44500` (AT2G44500) O-fucosyltransferase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819057] identity=67.6; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0563000` - identity=36.8; qcov=0.798; evalue=4.44e-79; confidence=medium
GO	GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF10250 (O-FucT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015950

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057800455.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800455.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800455.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800455.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800455.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44226570`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B33,D10
`Chr3:44226669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr3:44226819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B85,B9,D1
`Chr3:44226822`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:44226826`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C23
`Chr3:44227123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C71
`Chr3:44227136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B85,D1
`Chr3:44227195`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	24	A14,A23,A5,A7,B124,B129,B138,B14,B17,B27,B32,B45,B51,B61,B63,B72,B73,B84,B89,C17,C52,C56,C73,D4
`Chr3:44228212`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:44228260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,C26
`Chr3:44228353`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B109,B112,C79
`Chr3:44228463`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B122,B19,C13

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800455.1

535 aa

268

535

O-FucT

PF10250 O-FucT 145-462 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800455.1`	Pfam	`PF10250`	O-FucT	Family	145	462	2e-85	288.2	GDP-fucose protein O-fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944472.1
ATCCAACAGGTTTTCGCGTTCCCGCCGCCACCACTTTCCTCACTCTGCCAACCTTTTCTTTCTTTTTTATTGGGACTTCGCTTTTCTCTTTCTCTGTCAACTTAAAACATTTCCTAGAAAGCTCAACAAAAATCCTCAACACTAATAAATCACTAATTACAGTCACATCTAAAACTGTTCCAACCATTTTCTCCTCCTAAAATCCACACGTTTCTTCATCAACTCTGCAATGGCGGTGTCCAAGAGCAACAAGAAGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015950
ATGGCGGTGTCCAAGAGCAACAAGAAGAGCTACATTTCCGTTCCCTCGCAGATCATCAACTCCATCTCGCAGTCATCGCTCGATTCTTTGCTGCAGCCCCCCAAAAAGAAGCAGCAAACTTCATGTTCAAAGCTTAGGGTTTTCCTCAAGAGCTCAAGATTCTTCATTTTCCTCATCTGTCTGCTGGGCTTCCTCTGGATGTTGAAGATGCTGTTCAACTTCGACGCCTCGATGCCCTTTTCGCAGTTTCCTTGTTCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800455.1
MAVSKSNKKSYISVPSQIINSISQSSLDSLLQPPKKKQQTSCSKLRVFLKSSRFFIFLICLLGFLWMLKMLFNFDASMPFSQFPCSVSQESEAAITNGVSISELENGDESEFWKQPDGMGYRPCLDFSGRYRRESGEIVKDRTKYLMVVVAGGMNQQRNQIIDAVVISRILGAALVVPILQKNVIWADESEFGDIFDLDHFKSVLANDVRIVSSLPSTHLMTRPVEEKRTPLHASPDWIRSHYHKKLRREGVLLLRGLDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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