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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002788`

染色体: Chr03 坐标: 44393563-44398372 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002788`
名称	SmilChr03G002788
描述	sister chromatid cohesion 1 protein 3-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44393563 - 44398372 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015957`
GeneID	`131015957`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015957`
原始查询	`SmilChr03G002788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	sister chromatid cohesion 1 protein 3-like
产物	sister chromatid cohesion 1 protein 3-like
Arabidopsis	`AT3G59550` (SYN3) Rad21/Rec8-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825124] identity=34.5; qcov=1.11; evalue=3.83e-99; confidence=low
Rice	`Os08g0266700` (OsRad21-3) - identity=32.3; qcov=1.16; evalue=2.46e-75; confidence=low
GO	GO:0000795 (synaptonemal complex); GO:0003682 (chromatin binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0007064 (mitotic sister chromatid cohesion); GO:0007130 (synaptonemal complex assembly); GO:0008278 (cohesin complex); GO:1990414 (replication-born double-strand break repair via sister chromatid exchange)
KEGG	-
Pfam	PF04824 (Rad21_Rec8); PF04825 (Rad21_Rec8_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015957

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800459.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057800459.1`
3	Centromere	着丝粒	0.60000	`XP_057800459.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800459.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800459.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44394692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr3:44395374`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr3:44395449`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A16,A6,B77,C48
`Chr3:44395752`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:44395965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr3:44395989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,C13
`Chr3:44396333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B84,C84
`Chr3:44396573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr3:44396628`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:44396874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr3:44396891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:44397176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B132,B137,B76,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800459.1

659 aa

330

659

Rad21_Rec8_N

Rad21_Rec8

PF04825 Rad21_Rec8_N 1-101 aa PF04824 Rad21_Rec8 600-652 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800459.1`	Pfam	`PF04825`	Rad21_Rec8_N	Family	1	101	6.5e-38	130.0	N terminus of Rad21 / Rec8 like protein
`XP_057800459.1`	Pfam	`PF04824`	Rad21_Rec8	Family	600	652	2.6e-17	62.6	Conserved region of Rad21 / Rec8 like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944476.1
CCACGTACAACTGTCAACGTACGTGGGAAGCTGCTCATTACTTATTTAGTGGCAGTTTCGTAAATCTGGAGAACTACAGGCCCAATTAAATAAATTATCAAATTCACATTTCTTTTATTTTCGCGCCTTTCGGTTCCCGCTCCGTTCTGAAACCCTTTCTCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTTCACTCGCATACACCATTACTGCACGCACACACACATTAAGGTTTACAGAGGAAAAGAGACGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015957
ATGTTCTACTCGCATACGTTTTTGGCAAGGAAGGGCCCGTTGGGGACTGTTTGGTGTGCCGCCCATTTGCAGCACAAGCTCAAAAAGTCTCACTACGTCAAGACAAACGTCTCTACCACCGTCGAAAAAATCATGAATCCTGAAGTGCCGATTGCCCTGAGAATGTCAGGTCATCTTCTGCTTGGGGTTGTGCGGATATATTCGAAACAAGTTGACTATTTTTTTGAAGACTGCAATGAAATAAGGATCACAATTAACCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800459.1
MFYSHTFLARKGPLGTVWCAAHLQHKLKKSHYVKTNVSTTVEKIMNPEVPIALRMSGHLLLGVVRIYSKQVDYFFEDCNEIRITINRVFTTVTVNLPSDATQAPFHSVTLPEKFDLDTIKLDDYNVDWREDSHLKSQDEITLIEQIPTGKDPYIVISFDEQDLRTSSLMEDTLGSGSTPMEEDDVPRVELDASAAGFESPYPSNKLGADGSKTPQDVPSVEVMRDAQHGFDFNNSPILPDRADPDKFLEDQINRDKEVQT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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