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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002791`

染色体: Chr03 坐标: 44406262-44408604 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002791`
名称	SmilChr03G002791
描述	30S ribosomal protein 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44406262 - 44408604 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015960`
GeneID	`131015960`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015960`
原始查询	`SmilChr03G002791`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	30S ribosomal protein 2, chloroplastic
产物	30S ribosomal protein 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT3G52150` (PSRP2) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824379] identity=71.8; qcov=0.764; evalue=2.72e-96; confidence=high
Rice	`Os09g0279500` - identity=65.2; qcov=0.748; evalue=1.35e-82; confidence=high
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005829 (cytosol)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015960

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800460.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057800460.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800460.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800460.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800460.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44406666`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B136,B4,B52,C41
`Chr3:44407101`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr3:44407151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr3:44408176`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B137,B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800460.1

246 aa

123

246

RRM_1

PF00076 RRM_1 71-141 aa PF00076 RRM_1 172-242 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800460.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	71	141	1.1e-40	138.0	RNA recognition motif
`XP_057800460.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	172	242	1.1e-40	138.0	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944477.1
GAAAATGCAGTTGGTGCTTGGTATTTGGAAAACGGATAAAAGTGTGGGATAAATCCGCGAAACTGCTCTTATCTATACATTTCTCTCCCAACCCTTAAACCTCCATCCATATTCAACAAATCTCTTGAAGAAGAGATGGCCACTGTTTCTTCATCTTCCTTTGTAATTTCTCCAAATTTCCTTCAAGAATCCACTAAACCCTTCAAAACTAATCTCTTAAAGCTCAATTTCCAGCCGCACAAGCCACAGTCTCTCCCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015960
ATGGCCACTGTTTCTTCATCTTCCTTTGTAATTTCTCCAAATTTCCTTCAAGAATCCACTAAACCCTTCAAAACTAATCTCTTAAAGCTCAATTTCCAGCCGCACAAGCCACAGTCTCTCCCTCTAAAATTTACTCACAGAAGACTCAATGCAGTGGCGGAGGACACTTCTGTCGCCACGGCGGACCCCTCATCTGTGGCGGCCAGAAGATTGTACGTCGGAAACATCCCCAGAACTGTCAAGAACGATGAGCTCCAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800460.1
MATVSSSSFVISPNFLQESTKPFKTNLLKLNFQPHKPQSLPLKFTHRRLNAVAEDTSVATADPSSVAARRLYVGNIPRTVKNDELQKIVEEHGAVEKAEVMYDKYSGRSRRFAFVTMKTVEDAAAAAEKLNGTQIGGREVKVNITEKPLQTLESSSLLQAEDSQFVDSQYKVYVGNLAKTVTSDSLKAFFAEKGNALSAKVSRVPGTSKSSGYGFVTFASEEDVDAAISSLNNAVFEGQKIRVNKA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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