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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002794`

染色体: Chr03 坐标: 44419615-44428807 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002794`
名称	SmilChr03G002794
描述	chaperone protein dnaJ GFA2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44419615 - 44428807 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015963`
GeneID	`131015963`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015963`
原始查询	`SmilChr03G002794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ GFA2, mitochondrial-like
产物	chaperone protein dnaJ GFA2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G48030` (GFA2) gametophytic factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834854] identity=58; qcov=0.993; evalue=6.91e-171; confidence=high
Rice	`Os12g0168400` (OsDjA11) - identity=60.2; qcov=0.864; evalue=3.23e-157; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0009408 (response to heat); GO:0031072 (heat shock protein binding); GO:0042026 (protein refolding); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0051085 (GO:0051085)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ); PF00684 (DnaJ_CXXCXGXG); PF01556 (DnaJ_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015963

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057800462.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057800462.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057800463.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800462.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800462.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44420753`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:44421285`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr3:44422050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr3:44425483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C6
`Chr3:44425492`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C50
`Chr3:44427943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:44428254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800462.1

448 aa

224

448

DnaJ

DnaJ_C

DnaJ_CXXCXGXG

PF00226 DnaJ 88-150 aa PF01556 DnaJ_C 198-410 aa PF00684 DnaJ_CXXCXGXG 224-283 aa

XP_057800463.1

413 aa

206

413

DnaJ

DnaJ_CXXCXGXG

DnaJ_C

PF00226 DnaJ 53-115 aa PF00684 DnaJ_CXXCXGXG 189-248 aa PF01556 DnaJ_C 251-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800462.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	88	150	1.4e-26	93.0	DnaJ domain
`XP_057800462.1`	Pfam	`PF01556`	DnaJ_C	Domain	198	410	2.2e-45	155.2	DnaJ C terminal domain
`XP_057800462.1`	Pfam	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	Domain	224	283	4.3e-13	50.0	DnaJ central domain
`XP_057800463.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	53	115	1.3e-26	93.2	DnaJ domain
`XP_057800463.1`	Pfam	`PF00684`	DnaJ_CXXCXGXG	Domain	189	248	3.9e-13	50.2	DnaJ central domain
`XP_057800463.1`	Pfam	`PF01556`	DnaJ_C	Domain	251	375	1.2e-42	146.3	DnaJ C terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098804.1
AGCGGTTCCGATTCGACTTTGCTCAGCCCTACTTCTCCCCTAAGATTAGTGACGATTAGGGTTTATCGAGGGTTTTTGTGAGTTTACCAAAGACCTCTCTTTTCGGTTTCTACATTTGCAGTATCAATCAATGGCGCGGTTCCAAGGCCTCCGCCTCGCCCGCCGCTCCCTCTCCTGCATTCTTCTCCGCTACTCGCCTTCATATGAGTTTCAGCACCTCGCTGTCCAGTCAATCCCGGGTTATTTCAAATGCCAAATTA...

XR_009098803.1
TCCGATTCGACTTTGCTCAGCCCTACTTCTCCCCTAAGATTAGTGACGATTAGGGTTTATCGAGGGTTTTTGTGAGTTTACCAAAGACCTCTCTTTTCGGTTTCTACATTTGCAGTATCAATCAATGGCGCGGTTCCAAGGCCTCCGCCTCGCCCGCCGCTCCCTCTCCTGCATTCTTCTCCGCTACTCGCCTTCATATTTGTGTGATTCGCTATTGAATGACGCATGCAGGAGTTTCAGCACCTCGCTGTCCAGTCAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015963
ATGGCGCGGTTCCAAGGCCTCCGCCTCGCCCGCCGCTCCCTCTCCTGCATTCTTCTCCGCTACTCGCCTTCATATTTGTGTGATTCGCTATTGAATGACGCATGCAGGAGTTTCAGCACCTCGCTGTCCAGTCAATCCCGGGTTATTTCAAATGCCAAATTAGGAAATGTGGGCAGCGAGAATTATTGGCTGAAGCTACGATTTTCCAATAATAACTTGGGTGCAGCGAGGTCAATTCACAGCACTGCTCAATTATCTAG...

LOC131015963
ATGAGTTTCAGCACCTCGCTGTCCAGTCAATCCCGGGTTATTTCAAATGCCAAATTAGGAAATGTGGGCAGCGAGAATTATTGGCTGAAGCTACGATTTTCCAATAATAACTTGGGTGCAGCGAGGTCAATTCACAGCACTGCTCAATTATCTAGAGATTATTACGATTTACTCGGTGTTAGTAAATGTGCAACTGCTCCAGAAATCAAGAAAGCTTATTATGGGCTCGCAAAGAAGTTACATCCAGATACAAATAAGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800462.1
MARFQGLRLARRSLSCILLRYSPSYLCDSLLNDACRSFSTSLSSQSRVISNAKLGNVGSENYWLKLRFSNNNLGAARSIHSTAQLSRDYYDLLGVSKCATAPEIKKAYYGLAKKLHPDTNKDDPEAEKKFQEIQKAYEVLKDEVKRQQYDQLGHEAFEHAGSGEGPGFDPFGDAFQDIFKNADIFNIFNRDMGGEDVKASLELSFMEAIQGCTKTMSIVMDLACNTCGGTGVPPGTRPQTCKRCRGSGMVVSQAAHMTLQ...

XP_057800463.1
MSFSTSLSSQSRVISNAKLGNVGSENYWLKLRFSNNNLGAARSIHSTAQLSRDYYDLLGVSKCATAPEIKKAYYGLAKKLHPDTNKDDPEAEKKFQEIQKAYEVLKDEVKRQQYDQLGHEAFEHAGSGEGPGFDPFGDAFQDIFKNADIFNIFNRDMGGEDVKASLELSFMEAIQGCTKTMSIVMDLACNTCGGTGVPPGTRPQTCKRCRGSGMVVSQAAHMTLQSTCPNCGGTGKIVSNLCKSCKGRRVVRGTKAVKFN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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