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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002800`

染色体: Chr03 坐标: 44482607-44483331 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002800`
名称	SmilChr03G002800
描述	protein LIM1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44482607 - 44483331 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015969`
GeneID	`131015969`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015969`
原始查询	`SmilChr03G002800`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LIM1
产物	protein LIM1
Arabidopsis	`AT3G07450` (AT3G07450) Bifunctional inhibitor/lipid-transfer protein/seed storage 2S albumin superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819933] identity=55.8; qcov=0.874; evalue=1.92e-40; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	GO:0005504 (fatty acid binding); GO:0009627 (systemic acquired resistance)
KEGG	-
Pfam	PF00234 (Tryp_alpha_amyl); PF14368 (LTP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015969

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057800470.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057800470.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800470.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800470.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44482708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800470.1

119 aa

119

LTP_2

Tryp_alpha_amyl

PF14368 LTP_2 26-113 aa PF00234 Tryp_alpha_amyl 51-115 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800470.1`	Pfam	`PF14368`	LTP_2	Family	26	113	6.3e-09	36.6	Probable lipid transfer
`XP_057800470.1`	Pfam	`PF00234`	Tryp_alpha_amyl	Domain	51	115	2.4e-08	34.8	Protease inhibitor/seed storage/LTP family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944487.1
ATGCCAAGAGAGATGATCCCAAAGACAAAGGCAGCCATAATGAATACGAGTATGAAGCTGGCTTGGTTGATGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGTCGCGATGGCGCAGGAAAGCACAGGCCATCCCTGCGGGAGCACCTTCTTCTCGGCTCTGGTTCAGCTCATCCCATGCAGGTCAGCAGTCGCTCCCTTCAGCCCCATCCCGCCAACCGAGGCCTGCTGCGCTTCCATCAAAGCACTCGGCCAACCTTGTCTCTGCGTGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015969
ATGCCAAGAGAGATGATCCCAAAGACAAAGGCAGCCATAATGAATACGAGTATGAAGCTGGCTTGGTTGATGGCGGTGGCGGTGGTGGTGGTCGCGATGGCGCAGGAAAGCACAGGCCATCCCTGCGGGAGCACCTTCTTCTCGGCTCTGGTTCAGCTCATCCCATGCAGGTCAGCAGTCGCTCCCTTCAGCCCCATCCCGCCAACCGAGGCCTGCTGCGCTTCCATCAAAGCACTCGGCCAACCTTGTCTCTGCGTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800470.1
MPREMIPKTKAAIMNTSMKLAWLMAVAVVVVAMAQESTGHPCGSTFFSALVQLIPCRSAVAPFSPIPPTEACCASIKALGQPCLCVLVNGPPISGVDRAMAIQLPEKCTANFEPCEMAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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