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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002811`

染色体: Chr03 坐标: 44564989-44568107 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002811`
名称	SmilChr03G002811
描述	transcription factor ICE1
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44564989 - 44568107 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015986`
GeneID	`131015986`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015986`
原始查询	`SmilChr03G002811`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor ICE1
产物	transcription factor ICE1
Arabidopsis	`AT3G26744` (ICE1) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822287] identity=53.4; qcov=0.998; evalue=2.37e-139; confidence=high
Rice	`Os11g0523700` (OsbHLH002) - identity=60.8; qcov=0.628; evalue=2.46e-105; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF22754 (bHLH-TF_ACT-like_plant)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015986

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800504.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800504.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800504.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800504.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800504.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44567097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B69,C77,C8
`Chr3:44567253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C38
`Chr3:44567409`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:44567542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40
`Chr3:44567571`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40
`Chr3:44567685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,C31,C4,C49,C57
`Chr3:44567727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B69,C77,C8
`Chr3:44567787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C38

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800504.1

492 aa

246

492

HLH

bHLH-TF_ACT-like_plant

PF00010 HLH 308-350 aa PF22754 bHLH-TF_ACT-like_plant 409-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800504.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	308	350	1.1e-09	38.7	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057800504.1`	Pfam	`PF22754`	bHLH-TF_ACT-like_plant	Domain	409	480	1.5e-10	41.7	Plant bHLH transcription factor, ACT-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944521.1
GCACGAAATGATTAGTTTTCAAACTAGAAAACACAAACACCCTTCTCCCTCTCTCTCTTTACTCTCTCTCTCTCTTAAATTAGTGAAAAGCTAGTTGCCTTTTTAGCCTACGTCTCTGCATTCTGCAACTCTCTTTTGCAGATAAACAAACAAAGCCTTCCGTCCACACCCACAAATACAATGCTGCCCCGCTCCAACACGGCCCTCTGGATGGACGGAGAAGAAGACGAGGCCATCTCATGGCCACCGCCTCGGACCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015986
ATGCTGCCCCGCTCCAACACGGCCCTCTGGATGGACGGAGAAGAAGACGAGGCCATCTCATGGCCACCGCCTCGGACCCCCGCCGACGCAATCAACAACGCCTCCTTCAAGTCCATGCTCGACCCCGATTGCTTCATCAACACGCCCAATCCATTCTATCACCCTGAATTCAGCACCCTTTTATTCAATCCCTTGGATTCCTCTTCCTCCTGCTCTCCCTCGCACCCCTTCCACCTCGATCCCTCGCACCAGATGCCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800504.1
MLPRSNTALWMDGEEDEAISWPPPRTPADAINNASFKSMLDPDCFINTPNPFYHPEFSTLLFNPLDSSSSCSPSHPFHLDPSHQMPAFLPPKSMLPSLFTNNFDNGFDLSCDQSFFPAPDASSAPILMGFNGFNSQFQSSSEFQTASRMLPFSEDNAAATATAIGGASNAFNFEGFDASGGLYPNRSKLLRPLEVQPSVGAQPTLFQKRAALRQSSRLQNLGTMSSKSDEGLTSVDDTGGMDMGRKRKRNFEDEMEDMGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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