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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002821`

染色体: Chr03 坐标: 44707027-44709635 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002821`
名称	SmilChr03G002821
描述	uncharacterized SmilChr03G002821
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44707027 - 44709635 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015992`
GeneID	`131015992`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015992`
原始查询	`SmilChr03G002821`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831250]; symbol=AT5G14020; hit=AT5G14020; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831250]; symbol=AT5G14020; hit=AT5G14020; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G14020` (AT5G14020) Endosomal targeting BRO1-like domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831250] identity=58.8; qcov=0.988; evalue=7.03e-159; confidence=high
Rice	`Os11g0514800` - identity=52.5; qcov=0.993; evalue=9.19e-135; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03097 (BRO1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015992

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057800515.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057800515.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800515.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800515.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44708004`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr3:44708206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B139,C17,C35,C63
`Chr3:44708208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C35,C63
`Chr3:44708248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C13,C42
`Chr3:44708268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,B82,B85,C63
`Chr3:44708445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B130
`Chr3:44709123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B72,B9,C84
`Chr3:44709395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800515.1

403 aa

202

403

BRO1

PF03097 BRO1 50-309 aa

XP_057800516.1

403 aa

202

403

BRO1

PF03097 BRO1 50-309 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800515.1`	Pfam	`PF03097`	BRO1	Repeat	50	309	2.6e-12	47.0	BRO1-like domain
`XP_057800516.1`	Pfam	`PF03097`	BRO1	Repeat	50	309	2.6e-12	47.0	BRO1-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944533.1
AAGTACAAGTCCACACCACTACTGTGGCTTAGCTATACAAAAATCATGTTCATGTTCATGTATAATACTCGATTTTATACAATGGGCTCAATATATACATATATCATCAACACAAACTTCTGCCTTCTTCCTTCCCCTCTTTCCTGCTAATGCTACATTTTGAACAATCAAGAAATATCAATGGGGTGCACGAATTCTGTTTATGCAATCGGTAAAAAGAAGAAGAAGATCGTTCCAGAAATCTCCATTTTTTCCCCAGT...

XM_057944532.1
GTTTTTACATTATGGTGTGCACATGTACACATACAAAATACTTACCAACATTTGACTTTTGTATTATCACTTCATATTTATCTTCTTCATTTTACTGAATAGTTCTAACTTGTTGTGAATGCGTAGAATGCTACATTTTGAACAATCAAGAAATATCAATGGGGTGCACGAATTCTGTTTATGCAATCGGTAAAAAGAAGAAGAAGATCGTTCCAGAAATCTCCATTTTTTCCCCAGTTTTACGAATTCCAATGCAGTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015992
ATGGGGTGCACGAATTCTGTTTATGCAATCGGTAAAAAGAAGAAGAAGATCGTTCCAGAAATCTCCATTTTTTCCCCAGTTTTACGAATTCCAATGCAGTCAGATTTGCAGAGAATTCTCAGAGGATTCGTTCCCAACGACATTGCTGATAGAATCGCATCAATCAGAAATCAGATTGCTTTAGTTGCAGAGGATACTGGAGGGTCTGCGATCAGTGAACTAGTTAGAGCATTGGAGGGATACTTGCCTCTTCTGGTTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800515.1
MGCTNSVYAIGKKKKKIVPEISIFSPVLRIPMQSDLQRILRGFVPNDIADRIASIRNQIALVAEDTGGSAISELVRALEGYLPLLVGLTKKEYGLQELVEFRWRELGEEREEIYGANSWFELLSVLHMMAMLTLMEANEKLIPKESSLSERLVSADCMRDAVDLLLKAAGYLNFCVLDVLPRLPAELKKKLPSDMQGHVLEAISHQALAQGTEIQLGLAVQSKNATLSVKRRLACEQLSFYAQAYCCLSDKNESSAALKK...

XP_057800516.1
MGCTNSVYAIGKKKKKIVPEISIFSPVLRIPMQSDLQRILRGFVPNDIADRIASIRNQIALVAEDTGGSAISELVRALEGYLPLLVGLTKKEYGLQELVEFRWRELGEEREEIYGANSWFELLSVLHMMAMLTLMEANEKLIPKESSLSERLVSADCMRDAVDLLLKAAGYLNFCVLDVLPRLPAELKKKLPSDMQGHVLEAISHQALAQGTEIQLGLAVQSKNATLSVKRRLACEQLSFYAQAYCCLSDKNESSAALKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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