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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002822`

染色体: Chr03 坐标: 44709761-44710933 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002822`
名称	SmilChr03G002822
描述	CASP-like protein 1F2
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44709761 - 44710933 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016016`
GeneID	`131016016`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016016`
原始查询	`SmilChr03G002822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	CASP-like protein 1F2
产物	CASP-like protein 1F2
Arabidopsis	`AT4G25040` (AT4G25040) Uncharacterized protein family (UPF0497) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828607] identity=34.6; qcov=0.867; evalue=1.21e-24; confidence=low
Rice	`Os07g0442900` - identity=31.7; qcov=0.928; evalue=2.34e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04535 (CASP_dom)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016016

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057800552.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800552.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800552.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800552.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44710110`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B11
`Chr3:44710110`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B11
`Chr3:44710154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr3:44710381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr3:44710564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800552.1

180 aa

180

CASP_dom

PF04535 CASP_dom 8-154 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800552.1`	Pfam	`PF04535`	CASP_dom	Domain	8	154	3.6e-35	121.7	Casparian strip membrane protein domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944569.1
AGTCTCATATATATAGATTTGAAATACGAGCGATTTTGGTAATTACTTGTCCGTCTCCTCGTTCCTGCATTTTCACTTTCCCATCTAAATCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGATTTCCTCCATTAATCCCTTCCTCATCCGTTCTCCATTTCTCACTTGCTGTATTTCACCGTATTTATATAAATTTTCATAAAGAAAAGGCTAGTGAAAGAAAAACTTGTATCAGCTCCGAAAATGAGCAGCCAAATCTTGAAGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016016
ATGAGCAGCCAAATCTTGAAGAAAAGTTTGTATTTTACAGAATTGGCCCTGAGAGTTGTGGTAATTGCATTTTCAGTGGCTGGAGCAATCTCCATGGTCACCAGCAAGGAGTCTGTAACTATGTTCGGAATCACGGTGAACGCCTCTTACACCTATTCCTCTTCTTTCAGATACAAAGTTGTTGCAGATTCTGTAGTTTGTGGCCTCACGGTGTTGTCGGTCATTCTCGTCATTTGGCTAAACCATCCTAAATCAAATCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800552.1
MSSQILKKSLYFTELALRVVVIAFSVAGAISMVTSKESVTMFGITVNASYTYSSSFRYKVVADSVVCGLTVLSVILVIWLNHPKSNPKNYFYLLLNDLVSLVLLVSACSAAMAIGFVGRYGQSQTGWVSICDRVQKFCDKIMVSIVISFLAAICLFLLTLMSAHNLKSHSFLESNSIPTN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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