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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002824`

染色体: Chr03 坐标: 44728945-44734011 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002824`
名称	SmilChr03G002824
描述	phytyl ester synthase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44728945 - 44734011 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015971`
GeneID	`131015971`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015971`
原始查询	`SmilChr03G002824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytyl ester synthase 2, chloroplastic-like
产物	phytyl ester synthase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G41120` (AT5G41120) Esterase/lipase/thioesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834114] identity=54; qcov=0.87; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0362100` - identity=51; qcov=0.889; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008374 (GO:0008374); GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF03982 (DAGAT); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015971

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800472.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057800472.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057800472.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800472.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44730269`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr3:44730317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B81,C83
`Chr3:44731316`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr3:44731772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B27,B36,B99,C14,C44
`Chr3:44732126`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C14
`Chr3:44732126`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C14
`Chr3:44732273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50
`Chr3:44732287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D8
`Chr3:44732678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B59
`Chr3:44732690`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:44732815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr3:44733020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800472.1

714 aa

357

714

Abhydrolase_6

Hydrolase_4

Abhydrolase_1

DAGAT

PF12697 Abhydrolase_6 167-373 aa PF12146 Hydrolase_4 168-373 aa PF00561 Abhydrolase_1 170-372 aa PF03982 DAGAT 507-578 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800472.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	167	373	2.4e-07	32.3	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057800472.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	168	373	1e-09	38.8	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057800472.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	170	372	1.4e-06	28.9	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057800472.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	507	578	8.4e-07	28.9	Diacylglycerol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944489.1
CTACCAAAATAAGCAAATCATCTCTCAGTCTCTCACTACTATTCTCACCGCATTCAAACACTCGCACCCGCTCTCACAAGTCACAATGCAGAAAAATATCGCAACAATTTAACATATACTATTCATGGCCGCCACCGCAGCATTCGCCGCCGTTATCTGGCCGTTGACCCTCCGCCAAAGATATGCATCCCCGACCACCGGAAAATTTAGGTCAATTTCAAAGCCTGAGCTCTCTGTTTATGCATCAGCGGTTCGGAAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015971
ATGGCCGCCACCGCAGCATTCGCCGCCGTTATCTGGCCGTTGACCCTCCGCCAAAGATATGCATCCCCGACCACCGGAAAATTTAGGTCAATTTCAAAGCCTGAGCTCTCTGTTTATGCATCAGCGGTTCGGAAAGAGAAACAGCCGCGAGAATTAGCTCCTTCCGTCTCCGATAGCAGCGCTGTGGGGAAGAAGCCGGCGGAGGAGATACCACCGAGTGGCGGCAGAGGTCGCGAGCCGGAGGCCGAGTCGGATGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800472.1
MAATAAFAAVIWPLTLRQRYASPTTGKFRSISKPELSVYASAVRKEKQPRELAPSVSDSSAVGKKPAEEIPPSGGRGREPEAESDDGLSSLKNYFDQCREFISKSDGGPPRWFSPLECRSQLKDSPLLLYLPGVDGVGLGLMMEHERLGKIFDIWCMHIPLKDRTPLTDLVKFVESTVKTEHLRVPNRPIYLVGESFGACLALAVAACNPEIDLPLILANPATSFGKSLLQPLTLLPLSAMMPEKLSSSLPYVLTLLLGN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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