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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002825`

染色体: Chr03 坐标: 44738665-44743638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002825`
名称	SmilChr03G002825
描述	phytyl ester synthase 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44738665 - 44743638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015972`
GeneID	`131015972`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015972`
原始查询	`SmilChr03G002825`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phytyl ester synthase 2, chloroplastic-like
产物	phytyl ester synthase 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G41120` (AT5G41120) Esterase/lipase/thioesterase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834114] identity=55.4; qcov=0.896; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0362100` - identity=53.6; qcov=0.878; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0008374 (GO:0008374); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00073 (Cutin, suberine and wax biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF03982 (DAGAT); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015972

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800473.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.60000	`XP_057800473.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057800473.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800473.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800473.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44738938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C8
`Chr3:44739116`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C42
`Chr3:44739118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr3:44739247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr3:44739278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr3:44741421`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:44741738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B73,C78
`Chr3:44742354`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800473.1

699 aa

350

699

Abhydrolase_6

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

DAGAT

PF12697 Abhydrolase_6 152-362 aa PF00561 Abhydrolase_1 155-362 aa PF12146 Hydrolase_4 157-361 aa PF03982 DAGAT 492-564 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800473.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	152	362	1.9e-09	39.2	Alpha/beta hydrolase family
`XP_057800473.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	155	362	3.2e-13	50.6	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057800473.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	157	361	8.2e-12	45.7	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057800473.1`	Pfam	`PF03982`	DAGAT	Family	492	564	7.1e-07	29.2	Diacylglycerol acyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944490.1
ATCTACAAGTCGCAATTTAAGTATAAAATCCGTGTTGGTATTTCTAATATATAGCAGTAGACTAGTAGCTCAATAACTCCAATTCAACTAATGTATGATTTGTCATTTTCATATATTTCATTAAATAACAGAAACAAATTCTTCTGTGTGTGTGTGTCTGGTTAATAAGCACACGCAGTGACGCGCACACACTCTCATAAATCATAATGCAGAAAAACATTTGAGCAATTTAAAAAATACTACATCCATGGCCACCACCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015972
ATGGCCACCACCGGTACTGGGGCATTCGCCGCCGGTATCTGGCCGTTGACCCGCTGCCGCGATGCATCCACCACCACCGCGAGAATTAGGCCAATCTCCAAGTCTAAGCTATCGGCCATTCGGACGGAGAAGCAGGTAGCTCCCTCCGTTTCCGACAACGGCGCCTTGGGGTTGGGGAAGAAGCAGCCGAGTAGTGGAGGCCGTGGCGAGCGGGAGGCGGAGACGGAGAACCGGAGCTCCACTTTGAGAGATTACTTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800473.1
MATTGTGAFAAGIWPLTRCRDASTTTARIRPISKSKLSAIRTEKQVAPSVSDNGALGLGKKQPSSGGRGEREAETENRSSTLRDYFEQSRELISRSDGGPPRWFSPLECRSPLKDSPLLLYLPGVVGVGMGLSLQHERLGKIFDIWCMHIPLTDRTSFTDLVKFVENAVKTEHSRSPNRPIYLLGESFGACLALAVAARNPNIDLVLILANPATSFGKSVSQSLLPLSTVMPEQLGSGLPYLLTLLLGNPAKAVTAAMRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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