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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002831`

染色体: Chr03 坐标: 44804631-44806144 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002831`
名称	SmilChr03G002831
描述	uncharacterized SmilChr03G002831
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44804631 - 44806144 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015993`
GeneID	`131015993`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015993`
原始查询	`SmilChr03G002831`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os09g0122100; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=35.4; qcov=0.955; evalue=5.83e-65; confidence=medium
Rice	`Os09g0122100` - identity=40.2; qcov=0.903; evalue=2.59e-82; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF26138 (DUF8040)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015993

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800517.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057800517.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057800517.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800517.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800517.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44804751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C55
`Chr3:44804751`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:44804756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	69	A21,A4,A7,B106,B119,B12,B125,B130,B131,B133,B134,B137,B15,B2,B23,B24,B26,B27,B32,B37,B44,B48,B51,B54,B56,B58,B61,B62,B68,B71,B75,B81,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B96,C10,C12,C17,C2,C20,C25,C29,C34,C39,C40,C41,C43,C46,C5,C51,C53,C54,C56,C57,C64,C66,C71,C76,C77,C87,C9,D3,D5,D7,D8
`Chr3:44804779`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B76,C2
`Chr3:44804783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr3:44804818`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	B105,B11,B112,B113,B114,B115,B131,B134,B14,B20,B24,B25,B30,B31,B38,B39,B45,B51,B61,B80,B89,B90,B92,B93,C17,C19,C20,C27,C3,C43,C47,C51,C6,C64,C66,C7,C75,C78,C83,C85,C9,D1,D3
`Chr3:44804838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr3:44804855`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C82
`Chr3:44804855`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C82
`Chr3:44804880`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr3:44804898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr3:44804949`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800517.1

402 aa

201

402

DUF8040

DDE_Tnp_1

DDE_Tnp_4

Plant_tran

PF26138 DUF8040 63-149 aa PF01609 DDE_Tnp_1 174-341 aa PF13359 DDE_Tnp_4 181-342 aa PF04827 Plant_tran 272-344 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800517.1`	Pfam	`PF26138`	DUF8040	Domain	63	149	3.6e-24	85.2	Domain of unknown function (DUF8040)
`XP_057800517.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	174	341	3.5e-12	47.2	Transposase DDE domain
`XP_057800517.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	181	342	2.8e-25	89.5	DDE superfamily endonuclease
`XP_057800517.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	272	344	1.2e-05	25.7	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944534.1
TGCATAACAATATGCCATCTCGATGCCGTATAAATGCTTATGTCTACTCGATGGTTGAAGAGATTTTGCATCAGCTTATGTTGCAACTTGTAATCGTTGCCGATCACATAACTTGTATTAAAACAAGGAAGAGGAAACGGGCTGTAGTGACAGAGCCTTATCATATCTTGCCCCGTATCCCCGATCAAATAAAACACATGAATAGGCTCACGAATGTCAGTGACGTTGACTGCATTATAAACTTACGTATGGATCGCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015993
ATGCCATCTCGATGCCGTATAAATGCTTATGTCTACTCGATGGTTGAAGAGATTTTGCATCAGCTTATGTTGCAACTTGTAATCGTTGCCGATCACATAACTTGTATTAAAACAAGGAAGAGGAAACGGGCTGTAGTGACAGAGCCTTATCATATCTTGCCCCGTATCCCCGATCAAATAAAACACATGAATAGGCTCACGAATGTCAGTGACGTTGACTGCATTATAAACTTACGTATGGATCGCAATACGTTTGGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800517.1
MPSRCRINAYVYSMVEEILHQLMLQLVIVADHITCIKTRKRKRAVVTEPYHILPRIPDQIKHMNRLTNVSDVDCIINLRMDRNTFGRLCQLLRQLGGLHNSRYIGVEEQVAMFLSVLAHHKKNRVVRFDFRRSGDTITRYVHIVLKAVLSLHVLLFVKPCPIADDCIDPRWRWFKGCLGALDGTYIDVMVPNQDKPRYRTRKGHISTNTLAVCDRHLKFVYVLPGWEGSAADSRVLRDALNRPHGLRVPKGNYYLCDNGY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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