当前解析结果
SmilChr03G002832| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002832 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002832 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002832 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 44848608 - 44849314 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018861 |
|---|---|
| GeneID | 131018861 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018861 |
| 原始查询 | SmilChr03G002832 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018861 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057803542.1 |
| 2 | Nucleoplasm | 核质 | 0.40000 | XP_057803542.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057803542.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057803542.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057803542.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:44848609 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B129,B40,B58,C31 |
Chr3:44848613 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B1 |
Chr3:44848613 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr3:44848619 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B58,C31 |
Chr3:44848620 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B129,B58,C31 |
Chr3:44848622 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B108,C23,C55,D11,D8 |
Chr3:44848630 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B18,B19,B85 |
Chr3:44848645 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B118,B86,C53,C55 |
Chr3:44848647 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B129,C31 |
Chr3:44848652 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 8 | A18,B110,B124,B16,B8,B88,C22,C67 |
Chr3:44848672 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr3:44848712 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 26 | A13,A18,B110,B124,B132,B16,B34,B40,B44,B6,B61,B67,B75,B76,B8,B86,B88,B97,C12,C22,C33,C36,C46,C67,C8,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。