当前解析结果
SmilChr03G002838| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002838 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002838 |
| 描述 | actin-related protein 3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 44921275 - 44922526 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131016026 |
|---|---|
| GeneID | 131016026 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131016026 |
| 原始查询 | SmilChr03G002838 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | actin-related protein 3-like |
| 产物 | actin-related protein 3-like |
| Arabidopsis | AT1G13180 (DIS1)Actin-like ATPase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837876] identity=71.4; qcov=0.933; evalue=7.75e-28; confidence=medium |
| Rice | Os02g0596900 (ARP3)- identity=68.1; qcov=0.96; evalue=1.61e-29; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131016026 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057800564.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057800564.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057800564.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800564.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800564.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:44921849 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B15,B52,C61 |
Chr3:44921882 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr3:44921883 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B103,B105,B129,B47,B67 |
Chr3:44922110 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,C47,C51 |
Chr3:44922146 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
Chr3:44922196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
Chr3:44922198 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B130 |
Chr3:44922228 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B37 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。