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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002840`

染色体: Chr03 坐标: 44948529-44952325 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002840`
名称	SmilChr03G002840
描述	probable protein S-acyltransferase 7
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44948529 - 44952325 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015988`
GeneID	`131015988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015988`
原始查询	`SmilChr03G002840`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein S-acyltransferase 7
产物	probable protein S-acyltransferase 7
Arabidopsis	`AT3G26935` (AT3G26935) DHHC-type zinc finger family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822311] identity=76.8; qcov=0.884; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0508300` - identity=63.7; qcov=0.921; evalue=9.47e-156; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0006612 (protein targeting to membrane); GO:0018230 (peptidyl-L-cysteine S-palmitoylation); GO:0019706 (protein-cysteine S-palmitoyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01529 (DHHC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057800506.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057800506.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.40000	`XP_057800506.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057800507.1`
5	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057800507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44948959`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C13
`Chr3:44948959`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C13
`Chr3:44949057`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B46,D11
`Chr3:44949057`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B46,D11
`Chr3:44949059`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B46,D11
`Chr3:44949059`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B46,D11
`Chr3:44949061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,D11
`Chr3:44949114`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B55,C71,D11
`Chr3:44949118`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	B55,C71,D11
`Chr3:44949118`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	B55,C71,D11
`Chr3:44949120`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B55,C71,D11
`Chr3:44949120`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B55,C71,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800506.1

441 aa

220

441

DHHC

PF01529 DHHC 150-276 aa

XP_057800507.1

380 aa

190

380

DHHC

PF01529 DHHC 89-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800506.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	150	276	6.7e-41	140.2	DHHC palmitoyltransferase
`XP_057800507.1`	Pfam	`PF01529`	DHHC	Family	89	215	4e-41	140.9	DHHC palmitoyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098814.1
AAAAAATTGAAGCAAACTCCATTAGTGATGGAGTGCAGTAAAAGCGTGAAAAATCCCGACAAATGGAAGCGATTTATATTTCCCGTCTCTTGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGGAGGAAGTGGCAAAACGGTCCACAACAAACTCCTCCTGGGCCCACACCAGTTCACTAGCCCAATCAGCAGTGCCCACGTCACTTTGACCCTTCTGTAAAGCGAGAACCCTCCCATCGAATCTCACTGTCCTCACACACAAAAGCACAC...

XM_057944523.1
AAAAAATTGAAGCAAACTCCATTAGTGATGGAGTGCAGTAAAAGCGTGAAAAATCCCGACAAATGGAAGCGATTTATATTTCCCGTCTCTTGAAAAAAAAAAGAAAAAAAAGGAGGAAGTGGCAAAACGGTCCACAACAAACTCCTCCTGGGCCCACACCAGTTCACTAGCCCAATCAGCAGTGCCCACGTCACTTTGACCCTTCTGTAAAGCGAGAACCCTCCCATCGAATCTCACTGTCCTCACACACAAAAGCACAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131015988
ATGTACGTGGTTCCTCCTCCGAATCGGGCCGATCCGTTAGCTGGATCCACTAATGGCTCCGACGAGCTCATGGTTTATCAGACTTGGAAAGGCAGTAATGATTTGATTCTTCTATTGCTAACATCTGGAAGAGATCCTGGCATCATTCCTCGAAATGCACATCCACCTGAACCGGAAGGCTATGATGGGAGTGTAGAAGGAGCTCAAACACCACAGTTACGCTTGCCCCGCATTAAGGAAGTTGAGGTTAATGGTGCTAC...

LOC131015988
ATGTACGTGGTTCCTCCTCCGAATCGGGCCGATCCGTTAGCTGGATCCACTAATGGCTCCGACGAGCTCATGGTTTATCAGACTTGGAAAGGCAGTAATAAATTTTTTCTCCAAGGAAGGTTTGTTTTTGGACCAGATGTAAGGTCGCTGGCTCTAACTATATTCCTGATTGTGGCTCCTGTAGCTGTTTTCTGCATCTTTGTTGCTCGAAAACTGATGGATGATTTTGTTGATGACTGGGGAGTATCAATTATGGTTAT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057800506.1
MYVVPPPNRADPLAGSTNGSDELMVYQTWKGSNKFFLQGRFVFGPDVRSLALTIFLIVAPVAVFCIFVARKLMDDFVDDWGVSIMVIAIVFTFYDLILLLLTSGRDPGIIPRNAHPPEPEGYDGSVEGAQTPQLRLPRIKEVEVNGATVKIKYCDTCMLYRPPRCSHCSICNNCVERFDHHCPWVGQCIGLRNYRFFFMFVFSTTLLCIYVFGFCWVYIKRITDTEKTSIWRAMINTPASIVLIIYTFIAVWFVGGLTAF...

XP_057800507.1
MYVVPPPNRADPLAGSTNGSDELMVYQTWKGSNDLILLLLTSGRDPGIIPRNAHPPEPEGYDGSVEGAQTPQLRLPRIKEVEVNGATVKIKYCDTCMLYRPPRCSHCSICNNCVERFDHHCPWVGQCIGLRNYRFFFMFVFSTTLLCIYVFGFCWVYIKRITDTEKTSIWRAMINTPASIVLIIYTFIAVWFVGGLTAFHLYLISTNQTTYENFRYRYDIRANPYNKGVVNNFKEIFCGPTPPSKNNFRAKVPREPALPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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