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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002842`

染色体: Chr03 坐标: 44963780-44965660 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002842`
名称	SmilChr03G002842
描述	uncharacterized SmilChr03G002842
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	44963780 - 44965660 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016013`
GeneID	`131016013`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016013`
原始查询	`SmilChr03G002842`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839526]; symbol=LSM2; hit=AT1G03330; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839526]; symbol=LSM2; hit=AT1G03330; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G03330` (LSM2) Small nuclear ribonucleoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839526] identity=88.3; qcov=0.305; evalue=8.19e-33; confidence=low
Rice	`Os08g0154700` - identity=86.7; qcov=0.305; evalue=2.1e-32; confidence=low
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0000932 (P-body); GO:0003723 (RNA binding); GO:0005688 (U6 snRNP); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex); GO:0071011 (precatalytic spliceosome); GO:0071013 (catalytic step 2 spliceosome); GO:1990726 (Lsm1-7-Pat1 complex)
KEGG	-
Pfam	PF01423 (LSM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016013

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057800549.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057800549.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057800549.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800549.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800549.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:44963862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr3:44963880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr3:44963900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr3:44963920`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A6,B123,B66
`Chr3:44963920`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A6,B123,B66
`Chr3:44963968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,B82
`Chr3:44964071`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	76	A13,A15,A2,A20,A23,B10,B100,B103,B104,B106,B107,B109,B114,B119,B120,B122,B127,B130,B136,B139,B16,B27,B28,B29,B3,B40,B43,B46,B5,B53,B54,B55,B56,B58,B62,B63,B64,B66,B68,B73,B74,B76,B78,B81,B84,B85,B91,B95,B96,B98,C16,C18,C2,C22,C24,C25,C27,C28,C38,C41,C47,C49,C50,C51,C57,C59,C65,C79,C81,C82,C84,C87,C9,D2,D3,D9
`Chr3:44964129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:44964164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B76,C47,C51
`Chr3:44965340`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:44965361`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B1,B131
`Chr3:44965361`	`T`	`TGA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B1,B131

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800549.1

197 aa

197

LSM

PF01423 LSM 7-50 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800549.1`	Pfam	`PF01423`	LSM	Domain	7	50	3e-11	43.6	LSM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944566.1
AGAGTCCTGTCTGCAACATACGAAACCTTATTTTGCAAAACCCGCACTTTGAATTGAGCCCAATTACTACTCATCTAGAAGCTTTTGAATCTCGCAGCGCAGGCACAGACGCAGTGAAACTGTGAAACTGAAAACCAATTTCCCGCACCAAATATGTTGTTCTTCTCGTATTTCAAGGATTTGGTGGGGAGAGAACTAACGGTGGAATTGAAGAACGATTTAGCGATTAGAGGGACTCTACATTCAGTGGATCAATATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016013
ATGTTGTTCTTCTCGTATTTCAAGGATTTGGTGGGGAGAGAACTAACGGTGGAATTGAAGAACGATTTAGCGATTAGAGGGACTCTACATTCAGTGGATCAATATCTCAACATTAAGCTGGAGAATACTAGGGTTGTTGATCAAGACAAGTACCCCCATATGTTTTGTTCTACTTTTTGCAGCTTTCAGTGTGAAACTGCTTTATCCGGGGATCTGTGGTCCGATATGTGCAATTGCCACCCGAGGGAGTTGATGTCGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800549.1
MLFFSYFKDLVGRELTVELKNDLAIRGTLHSVDQYLNIKLENTRVVDQDKYPHMFCSTFCSFQCETALSGDLWSDMCNCHPRELMSSFCMMPPEEKHAVANSPCPFLDVMSSKQWILRHKTRMEDFLFLHYLGNFLCEFGHMLFGRHLLSWSKLGLNVEFRRLIVINIASFCTITVNSDYVFTSLSLIACLASFTTF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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