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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002852`

染色体: Chr03 坐标: 45106738-45110477 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002852`
名称	SmilChr03G002852
描述	GRAS family protein RAM1-like
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45106738 - 45110477 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015977`
GeneID	`131015977`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015977`
原始查询	`SmilChr03G002852`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRAS family protein RAM1-like
产物	GRAS family protein RAM1-like
Arabidopsis	`AT1G66350` (RGL1) RGA-like 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842953] identity=44.4; qcov=0.569; evalue=1.16e-96; confidence=medium
Rice	`Os01g0646300` (OsSLRL1) - identity=44.4; qcov=0.572; evalue=3.58e-92; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03514 (GRAS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015977

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057800484.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800484.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800484.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057800484.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057800484.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45107016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B23,C55,D8
`Chr3:45107094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B94,C51
`Chr3:45107454`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:45107487`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40
`Chr3:45107565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B100,B20
`Chr3:45107596`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr3:45107634`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C55
`Chr3:45107675`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr3:45107679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B91,D10
`Chr3:45107685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,B40
`Chr3:45109702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B2,B83,C59
`Chr3:45109722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800484.1

673 aa

336

673

GRAS

PF03514 GRAS 308-672 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800484.1`	Pfam	`PF03514`	GRAS	Family	308	672	5.6e-130	434.3	GRAS domain family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944501.1
ACTTTTTATGCGTCTCGATTATTCTTGATCTTTCCCTAATTAATTTTCTTGGGTAGAGAAAATTAAGGTCACAAATTTACACACATATTATATGTGCGTTTATGATTTTGTCCTACATATGAGCCACATCCCCTTCTCTTTCACTACAATCTATGGAACAAGACAAGCATCCTAGTTCGATAAAAAGAGGTGCAACCACATAAACCAGCTTTAAATTTTCTAAATTCTCAAACAAGAAAGGAGAGGGAGAGAGAGAGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015977
ATGATGAAGCCTTCGTGTAGGAGCATGGCAAGTCTGATCAAGAGCGAGACAAAAAGCATCAAAACTGAGATGGGAAACCTCAAAATCTCAGAAGGCTGTCTGAAAAGCGAGACAAGTTGCTGCACAAAGCAAGAGCCAACAACAACAGACGATCGCGAGTCATCATCATCATCATCACTCAAGAAAAACTCAGATTTCGAGAGCCACGGCTTAACCCCGGTGGGCAGCCTCAGCAGCCTGCTCAACCCCACGAATCTCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800484.1
MMKPSCRSMASLIKSETKSIKTEMGNLKISEGCLKSETSCCTKQEPTTTDDRESSSSSSLKKNSDFESHGLTPVGSLSSLLNPTNLKFEENGDVEIHSPDYSLWESIFSDHVVDNDFMICSPVRNMQTSSYSYSYASPPRFSSPLGPNKGKGLSPLHRVFSSPNNQFMQVESLSSLPALETLLDDNYDTKEDDFVVFSPMKIAGADCYAAVPELLECLNMADSAPAIQVPLSQQLQQERQQEEQQQQRHFERCIQHQQPP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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