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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002853`

染色体: Chr03 坐标: 45115231-45115689 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002853`
名称	SmilChr03G002853
描述	uncharacterized SmilChr03G002853
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45115231 - 45115689 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131018864`
GeneID	`131018864`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131018864`
原始查询	`SmilChr03G002853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=26.9; qcov=0.98; evalue=5.03e-07; confidence=low
Rice	`Os02g0118800` - identity=24.5; qcov=0.941; evalue=2e-09; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131018864

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057803544.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057803544.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057803544.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057803544.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057803544.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45115254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr3:45115277`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr3:45115279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B24,B4,B93,C28
`Chr3:45115290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B132
`Chr3:45115290`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr3:45115297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A22,B104,B105,B118,B122,B20,B33,B73,B88,B9,B94,C78,C8,C82
`Chr3:45115318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,D10
`Chr3:45115345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	45	A1,A2,A3,A7,B10,B112,B113,B121,B123,B124,B125,B128,B137,B138,B17,B19,B21,B32,B38,B39,B45,B49,B5,B50,B55,B96,C16,C20,C23,C26,C28,C3,C35,C46,C52,C65,C67,C73,C84,C85,D2,D3,D4,D5,D6
`Chr3:45115355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A10,B48
`Chr3:45115369`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C6,C75
`Chr3:45115389`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A21,B123,B35,B38,B4
`Chr3:45115389`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A21,B123,B35,B38,B4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057803544.1

152 aa

152

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 3-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057803544.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	3	70	1.6e-13	51.8	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057947561.1
ATGTTGAAAAGAGTGTGGGATACACCGACACCACAGAAGGCAAGAGTCACGAGCTGGAGGATTCTGAGGAACAGGTTACCAACGTGCGATAATTTGAGGAAAAGAAACATCTTGGTTGGCGAAGAGGAGGGCTGGTCTAATGCTTGCTGCAATCAATTCGAATCGATAGCGCATGTGTTTTTGACGTGCCCAAAATCAGAAGCAGTGTGGATCAAAATGCAGAAATGGCTGAGAGTCAGTGCTCCACATCCACAAAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131018864
ATGTTGAAAAGAGTGTGGGATACACCGACACCACAGAAGGCAAGAGTCACGAGCTGGAGGATTCTGAGGAACAGGTTACCAACGTGCGATAATTTGAGGAAAAGAAACATCTTGGTTGGCGAAGAGGAGGGCTGGTCTAATGCTTGCTGCAATCAATTCGAATCGATAGCGCATGTGTTTTTGACGTGCCCAAAATCAGAAGCAGTGTGGATCAAAATGCAGAAATGGCTGAGAGTCAGTGCTCCACATCCACAAAATAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057803544.1
MLKRVWDTPTPQKARVTSWRILRNRLPTCDNLRKRNILVGEEEGWSNACCNQFESIAHVFLTCPKSEAVWIKMQKWLRVSAPHPQNIIAHFDAFTNMGKKKSCKFLSALWMCVNWMLWKYRNDSRFDDKTWEIQSFIREIRPDFGVGTRFIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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