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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002860`

染色体: Chr03 坐标: 45197546-45200841 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002860`
名称	SmilChr03G002860
描述	ACT domain-containing protein ACR6
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45197546 - 45200841 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131015989`
GeneID	`131015989`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131015989`
原始查询	`SmilChr03G002860`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ACT domain-containing protein ACR6
产物	ACT domain-containing protein ACR6
Arabidopsis	`AT3G01990` (ACR6) ACT domain repeat 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821217] identity=64.4; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0413100` (OsACR7) - identity=59.6; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01842 (ACT); PF13740 (ACT_6); PF26956 (ACT_ACR_D1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131015989

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057800508.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057800508.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057800508.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800508.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800508.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45198288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C7
`Chr3:45198687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr3:45199464`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,A7,B40
`Chr3:45200542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B97
`Chr3:45200562`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B57,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800508.1

445 aa

222

445

ACT_ACR_D1

ACT_6

ACT

PF26956 ACT_ACR_D1 31-104 aa PF13740 ACT_6 127-171 aa PF01842 ACT 127-173 aa PF01842 ACT 342-401 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800508.1`	Pfam	`PF26956`	ACT_ACR_D1	Domain	31	104	8.1e-52	173.7	ACR family N-terminal ACT domain
`XP_057800508.1`	Pfam	`PF13740`	ACT_6	Domain	127	171	5.6e-09	36.4	ACT domain
`XP_057800508.1`	Pfam	`PF01842`	ACT	Domain	127	173	9.5e-34	115.5	ACT domain
`XP_057800508.1`	Pfam	`PF01842`	ACT	Domain	342	401	9.5e-34	115.5	ACT domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057944525.1
AGAAGCCACGTCGCAGTTAGTTACTTCTACTCCCTGAGGCGAGTGAAGGGCCGCCTACATTTCCTACACAACTAATTCTCACTCCCCACTCTCTCTCTCTTATTTCTCTCTCTTCATTTTCTCTGCAAATATTCTTCCTCCTCAGATATTGGAGAAGACTCTGTTTTACAGCGCATGCGCACTCGCATTTTTCCCTTCCTACTTTTCTCCACTCCAATTATCTTCCTTTTGTCAGGGAAAATTTCTTGAAATGCTTGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131015989
ATGCTTGACAGATTTGAAAAAATGGATGACGAGTTTGCCAAGCTTCTCCGTAGGATCAATCCACCCAGGGTTGTGATTGATAATGATGCTTGTGAGGATGCAACTATAATACAGGTTGACAGTGTCAATAAGCATGGAATCCTCCTTCAGGTGGTCCAAATTCTGACAGATTTGGATCTTGTGATTAAGAAAGCGTACATTTCATCTGATGGAGGATGGTTCATGGATGTGTTCAACGTGATTGATCAAAATGGAAACAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800508.1
MLDRFEKMDDEFAKLLRRINPPRVVIDNDACEDATIIQVDSVNKHGILLQVVQILTDLDLVIKKAYISSDGGWFMDVFNVIDQNGNKIRDQEIISYIQERLESNDDLVEPSLKGLVGLVPSEEHTCIELTGRDRPGLLSEVCAVLTDLECNVVNAEIWTHNERAAAVVLVTDHTTGCAIEDSKRLAVIKELLCNVLRGNSDLNSARMTLPPPGVTQRQRRLHQIMFADRDYEKADKLVGGKVHAKTSRPHVIVTDCAEKD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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