当前解析结果
SmilChr03G002864| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002864 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002864 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr03G002864 |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 45258469 - 45259981 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131018867 |
|---|---|
| GeneID | 131018867 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131018867 |
| 原始查询 | SmilChr03G002864 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=31.6; qcov=0.517; evalue=2.97e-21; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131018867 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057803547.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057803547.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057803547.1 |
| 4 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.20000 | XP_057803547.1 |
| 5 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.20000 | XP_057803547.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:45258479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A14,B112,B131,B132,B21 |
Chr3:45258484 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A20,B104,B42,C80,D5 |
Chr3:45258485 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C35 |
Chr3:45258486 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A14,B132,B21 |
Chr3:45258488 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B111 |
Chr3:45258491 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B106,B60,B65,B8 |
Chr3:45258498 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B56,C12,C47 |
Chr3:45258516 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C60 |
Chr3:45258528 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B112,B138,C38 |
Chr3:45258550 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B27 |
Chr3:45258554 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B42,B47,C56 |
Chr3:45258559 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B42,B57,B65,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。