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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr03G002867`

染色体: Chr03 坐标: 45304300-45315887 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr03G002867`
名称	SmilChr03G002867
描述	ABC transporter I family member 11, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr03 / NC_080389.1
坐标与链方向	45304300 - 45315887 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131016006`
GeneID	`131016006`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131016006`
原始查询	`SmilChr03G002867`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter I family member 11, chloroplastic
产物	ABC transporter I family member 11%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G14100` (ABCI11) non-intrinsic ABC protein 14 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831259] identity=69.9; qcov=0.96; evalue=2.04e-120; confidence=high
Rice	`Os11g0490800` (ABCI7) - identity=64; qcov=0.942; evalue=3.73e-108; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0009941 (chloroplast envelope); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0042626 (ATPase-coupled transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00005 (ABC_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131016006

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057800538.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057800538.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057800538.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057800538.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057800538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr3:45309660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr3:45311368`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B114
`Chr3:45311368`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B114
`Chr3:45312994`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr3:45312994`	`GT`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr3:45313013`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	89	A1,A11,A15,A19,A20,A23,A25,A7,B1,B10,B102,B103,B104,B11,B111,B113,B114,B117,B118,B119,B12,B124,B126,B127,B132,B136,B137,B139,B17,B18,B20,B3,B33,B38,B4,B41,B42,B43,B47,B48,B5,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B7,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B80,B86,B95,B97,C15,C16,C19,C23,C28,C29,C3,C30,C31,C33,C34,C35,C37,C40,C45,C51,C52,C54,C56,C57,C59,C7,C71,C74,C75,C77,C83,C87,D1,D2,D3
`Chr3:45313189`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B28,B45,B83,C59,D4
`Chr3:45313189`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B28,B45,B83,C59,D4
`Chr3:45313246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,C85
`Chr3:45314011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057800538.1

277 aa

138

277

ABC_tran

PF00005 ABC_tran 67-221 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057800538.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	67	221	2.2e-25	90.6	ABC transporter

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009098816.1
CAGTATAATAGAATTCGTTATTACATCAGCTGAAAATCAGTTACTATCATATTTTCGCACCTCTCTAATGGCGAGCGTATGGCTTTCCTCATCGTCTCTGCTTGCTTCGAAACCGCCGATTGACAGTTCGTCAACTGCGTTCTTATCTCCACATCGCTTCAGTTTAAATTCGAAAAAAATTGGAGCGCGCAGAATTGCATGTGATTACTCCTGCTTCGAAATAAAGGGTGTCAGTTATCGACCTCCAGGAACTGTCGCTG...

XR_009098815.1
CAGTATAATAGAATTCGTTATTACATCAGCTGAAAATCAGTTACTATCATATTTTCGCACCTCTCTAATGGCGAGCGTATGGCTTTCCTCATCGTCTCTGCTTGCTTCGAAACCGCCGATTGACAGTTCGTCAACTGCGTTCTTATCTCCACATCGCTTCAGTTTAAATTCGAAAAAAATTGGAGCGCGCAGAATTGCATGTGATTACTCCTGCTTCGAAATAAAGGGTGTCAGTTATCGACCTCCAGGAACTGTCGCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131016006
ATGGCGAGCGTATGGCTTTCCTCATCGTCTCTGCTTGCTTCGAAACCGCCGATTGACAGTTCGTCAACTGCGTTCTTATCTCCACATCGCTTCAGTTTAAATTCGAAAAAAATTGGAGCGCGCAGAATTGCATGTGATTACTCCTGCTTCGAAATAAAGGGTGTCAGTTATCGACCTCCAGGAACTGTCGCTGATCTTCTGAATGGAATCAGCTTCTCCTTACCTGAGAAAAGTTTTGGTCTGATCTTTGGACGAAGCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057800538.1
MASVWLSSSSLLASKPPIDSSSTAFLSPHRFSLNSKKIGARRIACDYSCFEIKGVSYRPPGTVADLLNGISFSLPEKSFGLIFGRSGSGKTTLLQLIAGLSKPTSGSIYVQRYGEDGHPNQSPKMLQPRRVGIVFQFPERFFIADNILDEIIYGWPRQRAGLQLRELLASRLQKAMTSVGLTGIPLDKDPQSLSGGYKRRLALAIQLVQTPDLLILDEPLAGLDWKARADVVKLLRDLKKELALLVVSHDLKELAPLVDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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