当前解析结果
SmilChr03G002868| 统一新 Gene ID | SmilChr03G002868 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr03G002868 |
| 描述 | protein LAZY 1-like |
| 染色体 / SeqID | Chr03 / NC_080389.1 |
| 坐标与链方向 | 45305014 - 45309383 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131015998 |
|---|---|
| GeneID | 131015998 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131015998 |
| 原始查询 | SmilChr03G002868 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | protein LAZY 1-like |
| 产物 | protein LAZY 1-like |
| Arabidopsis | AT5G14090 (AT5G14090)regulator of nonsense transcript protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831258] identity=32.2; qcov=1.05; evalue=2.22e-37; confidence=low |
| Rice | -- |
| GO | GO:0009630 (gravitropism); GO:2000012 (regulation of auxin polar transport) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131015998 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057800525.1 |
| 2 | Cell membrane | 细胞膜 | 0.60000 | XP_057800525.1 |
| 3 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057800525.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057800525.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057800525.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr3:45307023 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr3:45309079 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 189 | A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A20,A22,A23,A24,A25,A4,A6,A7,B10,B103,B105,B106,B107,B109,B110,B111,B112,B113,B114,B117,B118,B120,B121,B122,B125,B126,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B139,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B20,B24,B25,B26,B27,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B36,B37,B40,B44,B45,B46,B48,B5,B50,B52,B53,B54,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B86,B87,B88,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C10,C12,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C35,C38,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C67,C68,C7,C70,C71,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。